猪链球菌对大环内酯类药物的耐药机制及MefA-MsrD基因的全序列分析

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目的:对临床分离的48株猪链球菌进行耐药性筛选;检测临床分离48株猪链球菌中大环内酯类及四环素类抗生素耐药基因的分布;分析临床分离的耐药猪链球菌与体外诱导耐药菌株的耐药机制的差异;对临床分离的4株含有mefA基因的猪链球菌中的mefA基因进行定位,并对其上下游未知序列进行分析。方法:采用微量稀释法测定10种药物对临床分离的48株猪链球菌的体外最小抑菌浓度(MIC)及改良双纸片法测定了48株菌对大环内酯类抗生素的耐药表型;建立PCR检测方法对分离菌株中大环内酯类耐药基因ermA/B/C、mefA、msrD、mphB.23S rRNA、L4、L22和四环素类耐药基因tetM、tetO、tetL、tetK及与Tn916转座子相关的int和xis基因进行检测;采用stepwise方法对敏感菌进行红霉素、泰乐菌素、阿奇霉素体外诱导耐药;建立PCR检测方法检测体外诱导耐药菌株耐药基因ermB、ermA、ermC、mefA、msrD、mphB的分布及扩增23S rRNA及核糖体蛋白L4及L22;测定利血平存在的条件下,大环内酯类药物对临床分离和体外诱导耐药菌株MIC的影响;采用DNA Walking(染色体步移技术)的方法获mefA基因的相邻未知序列并将所获得的序列进行拼接并在NCBI上进行分析。结果:猪链球菌对红霉素、泰乐菌素、替米考星及阿奇霉素的耐药率分别达33.33%(16/48)、27.08%(13/48)、27.08%(13/48)和33.33%(16/48);对青霉素、氨苄西林、阿莫西林、头孢曲松钠、头孢喹肟均敏感,对四环素均耐药;16株红霉素耐药菌株中,以内在型耐药表型为主,占75%(12/16),菌株MIC均为≥128 mg·L-1;M型占25%(4/16),大部分菌株MIC范围为1 mg·L-1;未检测到诱导型耐药表型;耐药基因主要以ermB为主,占75%(12/16),mefA和msrD占25%(4/16),16株耐药菌株中,tetM、tetO、int、xis的检出率分别为31.25%(5/16)、62.5%(10/16)、31.25%(5/16)和31.25%(5/16),没有检测到ermA/C、mphB、tetL、tetK。所有耐药菌株也均未检测到核糖体23Sr RNA、核糖体蛋白L4和L22突变;体外诱导的耐药菌株均未检测到大环内酯类药物耐药基因,耐药机制的产生主要是23S rRNA的位点A2061G、C2614A、A2062C及A2065C发生突变;核糖体蛋白L4的67-68之间插入S、Q及69-72位点插入W、P、Q、K和Q67R、K68T、R73G的突变;核糖体蛋白L22的84-86位点上发生3个氨基酸的缺失及K87Q突变引起的;在利血平存在的条件下,红霉素和阿奇霉素对具有mefA-msrD基因耐药菌的MIC会发生变化;泰乐菌素及替米考星对泰乐菌素诱导的具有L22氨基酸缺失的两株耐药菌株的MIC有明显变化;经DNA Walking测序,共得到5305 bp的基因片段,进一步分析显示mefA基因位于染色体DNA上,大小为1218 bp,下游为msrD基因,大小为1464 bp。在5305bp的片段中,共包括7个开放阅读框。
摘要第6-8页
ABSTRACT第8-9页
缩略词表第10-11页
引言第11-13页
第一章 文献综述第13-31页
    1 国内外猪链球菌对大环内酯类药物耐药状况第13-15页
    2 猪链球菌对大环内酯类药物耐药机制的研究第15-19页
        2.1 甲基转移酶Erm家族催化的甲基化引起的耐药第15-16页
        2.2 主动外排系统介导的耐药第16-18页
        2.3 核蛋白变异第18-19页
    3 四环素耐药基因terM、tetO与ermB、mefA关系的研究第19-21页
    4 大环内酯类药物研究进展第21-24页
    参考文献第24-31页
第二章 临床分离猪链球菌对大环内酯类抗生素的耐药性和耐药表型第31-41页
    1 材料与方法第32-33页
        1.1 菌株第32页
        1.2 培养基第32页
        1.3 药物第32-33页
        1.4 试验方法第33页
    2 结果第33-36页
        2.1 临床分离猪链球菌对大环内酯类等10种药物的敏感性第33-35页
        2.2 猪链球菌对MLS类抗生素耐药表型第35-36页
    3 讨论第36-38页
    参考文献第38-41页
第三章 临床分离猪链球菌中大环内酯类和四环素类耐药基因的分布第41-52页
    1 材料与方法第41-42页
        1.1 材料第41-42页
        1.2 方法第42页
    2 结果第42-46页
        2.1 大环内酯类、四环素类相关耐药基因的检测第42-45页
        2.2 猪链球菌对大环内酯类抗生素的基因表型和耐药表型的相关性第45-46页
        2.3 耐药基因序列比对及同源性分析第46页
    3 讨论第46-49页
        3.1 大环内酯类抗生素耐药基因检测第46-47页
        3.2 四环素耐药基因的检测第47页
        3.3 四环素耐药和大环内酯类抗生素耐药的关系第47-49页
    参考文献第49-52页
第四章 临床分离与体外诱导猪链球菌对大环内酯类药物耐药机制的差异第52-64页
    1 材料与方法第53-54页
        1.1 材料第53页
        1.2 方法第53-54页
    2 结果第54-57页
        2.1 体外人工诱导猪链球菌耐药菌株及对7种抗生素的敏感性第54页
        2.2 临床分离及体外诱导耐药菌株红霉素耐药基因的检测第54-55页
        2.3 临床分离与大环内酯类药物体外诱导猪链球菌耐药菌株突变基因的扩增第55-57页
        2.4 利血平对临床分离和体外诱导耐药菌株MIC的影响第57页
    3 讨论第57-60页
    参考文献第60-64页
第五章 介导猪链球菌耐药的mefA基因在猪链球菌中的定位第64-74页
    1 材料与方法第65-67页
        1.1 试验材料第65页
        1.2 方法第65-67页
    2 结果第67-72页
        2.1 mefA基因测序第67页
        2.2 mefA基因上游序列的获得第67-68页
        2.3 mefA-msrD基因序列的获得第68页
        2.4 msrD基因下游序列的获得第68-72页
    参考文献第72-74页
全文结论第74-75页
致谢第75-77页
攻读硕士期间论文发表情况第77页
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