MHC Ⅱ线性表位与空间表位之间的区别与联系

线性表位论文 空间表位论文 MHCⅡ论文 表位预测论文 疫苗设计论文
论文详情
作为机体的防御体系,体液免疫在人类战胜细菌、病毒、寄生虫及其它致病因子的能力方面起着至关重要的作用。在整个体液免疫的过程中,T细胞和B细胞处于核心的地位。通过预测T细胞识别表位以及B细胞识别表位来设计疫苗已成为免疫信息学中的热点。目前,针对T细胞识别表位的预测已取得较高的准确率,但预测出的表位多具有良好的MHC Ⅱ结合性而无良好的免疫原性;同时,对B细胞表位的预测仍未取得令人信服的结果。考虑到整个体液免疫过程中,助T细胞能够识别被MHC Ⅱ所呈递的抗原片段,从而被激活后释放细胞活素以刺激自身增殖,增值后的助T细胞释放大量白细胞介素-2(IL-2)进而促进B细胞增殖。B细胞若要分泌抗体中和抗原以起到免疫效应,必须要得到两方面的信息,即B细胞受体(BCR)所结合的抗原蛋白信息和助T细胞所释放的增殖信号。因此,有必要分析一下两种淋巴细胞识别抗原过程时的信号传导过程,确定T淋巴细胞识别抗原的方式是否对B淋巴细胞对抗原的识别产生了影响,以及两者之间是否有着信息的传递效应。通过分析MHC Ⅱ线性表位与空间表位之间的异同,可以为今后的表位预测提供新的思路。在B细胞表位预测过程中考虑线性表位的影响,从而提高其预测准确率;同时,在预测MHC Ⅱ线性表位时考虑空间表位的影响,使得预测出的表位更具有免疫原性,提高设计疫苗的有效性。
摘要第5-6页
Abstract第6页
第1章 前言第9-18页
    1.1 T细胞表位第10-13页
        1.1.1 MHC Ⅰ表位研究第10-12页
        1.1.2 MHC Ⅱ表位研究第12-13页
    1.2 B细胞表位第13-16页
    1.3 研究线性表位与空间表位异同的必要性及可行性第16-17页
    1.4 课题研究的目的与意义第17-18页
第2章 实验材料与方法第18-30页
    2.1 表位数据收集第18-19页
        2.1.1 MHC Ⅱ识别线性表位的收集第18页
        2.1.2 B细胞空间表位的收集第18-19页
    2.2 表位氨基酸残基组成第19页
    2.3 线性表位与空间表位识别位点异同第19-21页
        2.3.1 同时包含线性表位与空间表位信息的蛋白测试集的建立第20页
        2.3.2 线性表位与空间表位识别位点的异同第20-21页
    2.4 线性表位的超类型分析第21-23页
    2.5 肽段相似性分析第23-25页
        2.5.1 BLAST分析第23-24页
        2.5.2 FASTA分析第24-25页
    2.6 PD值分析序列相似性第25-28页
    2.7 实验分析流程图第28-30页
第3章 表位测试集的统计及其氨基酸组成分析第30-37页
    3.1 线性表位测试集的统计第30页
    3.2 空间表位测试集的统计第30-32页
    3.3 表位中氨基酸残基组成分析第32-34页
    3.4 MHC Ⅱ线性表位超类型(supertype)分布第34-35页
    3.5 本章小结第35-37页
第4章 MHC Ⅱ识别位点和抗体识别位点的异同第37-48页
    4.1 同时包含线性表位与空间表位信息的蛋白测试集的建立第37-39页
    4.2 MHC Ⅱ和抗体识别抗原时识别位点的异同第39-40页
    4.3 在空间表位中提取氨基酸连续片段第40-41页
    4.4 MHC Ⅱ线性表位与空间表位连续片段位点的异同第41-43页
    4.5 扩展蛋白测试集第43-46页
        4.5.1 寻找MHC Ⅱ线性表位在抗原蛋白中的相似片段第43-44页
        4.5.2 扩展MHC Ⅱ线性表位识别位点搜索更多连续片段第44-46页
    4.6 本章小结第46-48页
第5章 空间表位连续片段与MHC Ⅱ线性表位的相似性对比第48-56页
    5.1 BLAST搜索第48-49页
    5.2 FASTA搜索第49-50页
    5.3 PD值计算MHC Ⅱ线性表位与空间表位之间的相似性第50-53页
    5.4 氨基酸替代分析第53-55页
    5.5 本章小结第55-56页
第6章 结论与展望第56-59页
    6.1 结论第56-57页
    6.2 展望第57-59页
参考文献第59-67页
附录1 145个空间表位列表第67-84页
附录2 145个抗原蛋白空间表位连续片段第84-90页
致谢第90-91页
科研成果第91页
论文购买
论文编号ABS560899,这篇论文共91页
会员购买按0.30元/页下载,共需支付27.3
不是会员,注册会员
会员更优惠充值送钱
直接购买按0.5元/页下载,共需要支付45.5
只需这篇论文,无需注册!
直接网上支付,方便快捷!
相关论文

点击收藏 | 在线购卡 | 站内搜索 | 网站地图
版权所有 艾博士论文 Copyright(C) All Rights Reserved
版权申明:本文摘要目录由会员***投稿,艾博士论文编辑,如作者需要删除论文目录请通过QQ告知我们,承诺24小时内删除。
联系方式: QQ:277865656