摘要 | 第5-6页 |
Abstract | 第6页 |
第1章 前言 | 第9-18页 |
1.1 T细胞表位 | 第10-13页 |
1.1.1 MHC Ⅰ表位研究 | 第10-12页 |
1.1.2 MHC Ⅱ表位研究 | 第12-13页 |
1.2 B细胞表位 | 第13-16页 |
1.3 研究线性表位与空间表位异同的必要性及可行性 | 第16-17页 |
1.4 课题研究的目的与意义 | 第17-18页 |
第2章 实验材料与方法 | 第18-30页 |
2.1 表位数据收集 | 第18-19页 |
2.1.1 MHC Ⅱ识别线性表位的收集 | 第18页 |
2.1.2 B细胞空间表位的收集 | 第18-19页 |
2.2 表位氨基酸残基组成 | 第19页 |
2.3 线性表位与空间表位识别位点异同 | 第19-21页 |
2.3.1 同时包含线性表位与空间表位信息的蛋白测试集的建立 | 第20页 |
2.3.2 线性表位与空间表位识别位点的异同 | 第20-21页 |
2.4 线性表位的超类型分析 | 第21-23页 |
2.5 肽段相似性分析 | 第23-25页 |
2.5.1 BLAST分析 | 第23-24页 |
2.5.2 FASTA分析 | 第24-25页 |
2.6 PD值分析序列相似性 | 第25-28页 |
2.7 实验分析流程图 | 第28-30页 |
第3章 表位测试集的统计及其氨基酸组成分析 | 第30-37页 |
3.1 线性表位测试集的统计 | 第30页 |
3.2 空间表位测试集的统计 | 第30-32页 |
3.3 表位中氨基酸残基组成分析 | 第32-34页 |
3.4 MHC Ⅱ线性表位超类型(supertype)分布 | 第34-35页 |
3.5 本章小结 | 第35-37页 |
第4章 MHC Ⅱ识别位点和抗体识别位点的异同 | 第37-48页 |
4.1 同时包含线性表位与空间表位信息的蛋白测试集的建立 | 第37-39页 |
4.2 MHC Ⅱ和抗体识别抗原时识别位点的异同 | 第39-40页 |
4.3 在空间表位中提取氨基酸连续片段 | 第40-41页 |
4.4 MHC Ⅱ线性表位与空间表位连续片段位点的异同 | 第41-43页 |
4.5 扩展蛋白测试集 | 第43-46页 |
4.5.1 寻找MHC Ⅱ线性表位在抗原蛋白中的相似片段 | 第43-44页 |
4.5.2 扩展MHC Ⅱ线性表位识别位点搜索更多连续片段 | 第44-46页 |
4.6 本章小结 | 第46-48页 |
第5章 空间表位连续片段与MHC Ⅱ线性表位的相似性对比 | 第48-56页 |
5.1 BLAST搜索 | 第48-49页 |
5.2 FASTA搜索 | 第49-50页 |
5.3 PD值计算MHC Ⅱ线性表位与空间表位之间的相似性 | 第50-53页 |
5.4 氨基酸替代分析 | 第53-55页 |
5.5 本章小结 | 第55-56页 |
第6章 结论与展望 | 第56-59页 |
6.1 结论 | 第56-57页 |
6.2 展望 | 第57-59页 |
参考文献 | 第59-67页 |
附录1 145个空间表位列表 | 第67-84页 |
附录2 145个抗原蛋白空间表位连续片段 | 第84-90页 |
致谢 | 第90-91页 |
科研成果 | 第91页 |