土壤环境弓形虫与细菌污染的检测与修复

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土壤生物污染是指一个或几个有害的生物种群从外界环境侵入土壤,引起土壤质量下降,不仅破坏了原有的生态平衡,还会对植物、动物、人类健康以及生态系统造成不良的影响。近年来,随着人感染禽流感、SARS、猪链球菌病、猪流感等突如其来的疫病灾害的发生,以及人民生活水平的不断提高和环境保护意识的逐渐增强,土壤环境的生物污染问题越来越受到大家的关注。为此本研究选取弓形虫和粪便污染指示菌为代表,首先建立其检测方法,然后对土壤的污染情况进行调查,紧接着针对猪场土壤环境中大肠杆菌的污染情况,通过土壤载体试验、盆栽试验、现场模拟试验从化学消毒剂、生物消毒剂、复合型消毒剂中筛选几种可行的消毒剂,并从戊二醛对土壤微生态环境的影响和残留两个方面进行了戊二醛对土壤的安全性评价。(1)土壤环境中弓形虫卵囊检测方法的建立和应用建立了土壤环境中弓形虫卵囊的PCR/B1、PCR/529和LAMP/MIC3检测方法,检测极限分别为50、5和5个速殖子/0.5g土壤,特异性试验说明仅弓形虫RH株和Prugniaud株能扩增得到特异性目的条带。PCR/B1和PCR/529扩增均为阳性的样品判定为PCR阳性。用PCR和LAMP方法分别检测来自公园、猪场和校园的483份土壤样品,结果表明,两种方法分别得到81(16.77%)份和133(27.54%)份阳性样品,其中猪场土壤的污染最为严重。武汉市6个公园的检测结果表明,所有的公园都受到了不同程度的污染(P>0.05)。在12个被调查的猪场中,仅1个猫低密度猪场的土壤未受到污染,PCR和LAMP检测结果显示猫高密度猪场土壤阳性率分别为低密度猪场的2.24和2.21倍,表明猫的数量与土壤的污染情况呈正相关。公园和校园土壤污染的季节性分析显示,土壤全年受到弓形虫卵囊的污染,各季节之间差异极显著(P<0.01),且从春天到冬天呈现逐渐下降的趋势。因此,土壤可能是人和动物感染弓形虫的传染源之一。另外,建立的PCR和LAMP方法能有效检测土壤中弓形虫卵囊。(2)猪场土壤环境细菌性污染的调查以细菌总数和粪便污染指示菌(大肠杆菌、大肠菌群)为指标,采集湖北省17个规模化猪场共86份土壤样品进行检测与计数,并评价了土壤的污染程度。采用的方法分别为:细菌总数—涂布牛肉膏蛋白胨平板培养;大肠杆菌—PCR方法和涂布麦康凯平板培养;大肠菌群—MPN法。结果显示,PCR方法检测所有土样均为大肠杆菌阳性,土壤中细菌总数、大肠杆菌和大肠菌群分别为4.5×104~6.9×107cfu/g、O~1.2×106cfu/g.1.2×104~5.3×107cfu/g.根据细菌总数判定有72.09%的土壤污染严重。根据大肠杆菌判定有41.86%的土壤被粪便污染严重,大肠菌群已超出我国畜禽养殖业污染物排放标准规定的10-10,000倍,表明土壤中有肠道致病菌存在且已严重超标。秋季土壤大肠杆菌污染最为严重,其次是春天、冬天和夏天。(3)土壤中大肠杆菌消毒剂的筛选本研究选取依绿笑(二氧化氯)、安必杀(有效碘)、戊二醛、申嗪霉素(M18)、天然净等五种消毒剂对土壤中大肠杆菌进行消毒效果评价,从而筛选最佳消毒剂。大肠杆菌稀释液的筛选试验结果表明,0.1%Tween80/PBS的分散性最好。化学消毒剂的中和剂鉴定试验表明,0.5%Na2S203+1%Tween80可有效中和200mg/L的二氧化氯,0.5%Na2S203+1%卵磷脂+1%Tween80可有效中和2000mg/L的有效碘,1%甘氨酸+1%卵磷脂+1%Tween80可有效中和2%的戊二醛。土壤载体试验结果表明:2000mg/L有效碘作用30min,200mg/L二氧化氯作用2min或100mg/L作用1h,0.05%戊二醛作用15min或0.01%作用30min,100mg天然净添加于5g土壤中作用48h可完全杀灭土壤中大肠杆菌。但申嗪霉素对土壤中大肠杆菌和细菌总数均无影响。现场模拟试验结果表明:400mg/L二氧化氯作用24h或600mg/L二氧化氯作用12h,0.1%戊二醛作用12h可杀灭土壤中95%以上的大肠杆菌。(4)戊二醛处理对土壤的安全性评价戊二醛处理后,通过对土壤中可培养微生物进行平板计数,发现戊二醛对土壤中大肠杆菌作用明显,高浓度对细菌、真菌影响较小,但对放线菌影响较大,中、低浓度对细菌、真菌、放线菌的冲击小,且都能在一段时间内恢复正常水平。Biolog的结果显示,低浓度的戊二醛处理有轻微提高微生物活性的作用,中、高浓度处理则有抑制作用,但经过一段时间后微生物活性均能恢复正常。总而言之,虽然戊二醛处理对土壤中微生物对单一碳源的利用能力产生了影响,但各处理间无明显差异。另外,建立了土壤中戊二醛的高效液相色谱检测方法,戊二醛采用2,4-二硝基苯肼柱前衍生后检测,戊二醛在土壤中的最低检测限和最低定量限分别为0.01mg/kg和0.02mg/kg。土壤中戊二醛的消解测定结果表明,在第1d可消除70%及以上,第2d可消除97%以上。总之,戊二醛对土壤微生态环境的影响比较柔和,且不会因残留导致二次污染,是一种安全、高效的土壤生物污染消毒剂。
中文摘要第8-10页
Abstract第10-13页
缩略语表第14-16页
第一章 文献综述第16-33页
    1.1 土壤环境中生物污染现状第16-21页
        1.1.1 病原微生物在土壤环境中的分布规律第16-17页
        1.1.2 病原在土壤环境中的生存时间第17-18页
        1.1.3 土壤环境中生物污染的来源第18-19页
        1.1.4 土壤环境中生物污染的危害第19-21页
            1.1.4.1 土壤环境中生物污染对植物的危害第19页
            1.1.4.2 土壤环境中生物污染对人和动物的危害第19-21页
    1.2 土壤环境中传染性病原检测方法的研究进展第21-25页
        1.2.1 土壤环境中细菌的检测方法第21-22页
        1.2.2 土壤环境中病毒的检测方法第22-24页
        1.2.3 土壤环境中寄生虫的检测方法第24-25页
    1.3 土壤环境生物污染防治的研究进展第25-33页
        1.3.1 物理方法对土壤环境中病原微生物的作用第25-28页
            1.3.1.1 自然净化第26页
            1.3.1.2 机械清除第26页
            1.3.1.3 热力消毒第26页
            1.3.1.4 辐射灭菌第26-27页
            1.3.1.5 物理吸附第27-28页
        1.3.2 化学消毒剂对土壤环境中病原微生物的作用第28-30页
            1.3.2.1 化学消毒剂的分类第28-29页
            1.3.2.2 化学消毒剂在土壤消毒过程中的使用方法第29页
            1.3.2.3 化学消毒剂在土壤消毒中的应用第29-30页
        1.3.4 生物方法对土壤环境中病原微生物的作用第30-32页
        1.3.5 土壤环境中病原微生物消毒展望第32-33页
第二章 土壤环境中弓形虫卵囊检测方法的建立及应用第33-51页
    2.1 研究的目的与意义第33-34页
    2.2 材料与方法第34-41页
        2.2.1 菌株,虫株和载体第34-35页
        2.2.2 主要试剂第35页
        2.2.3 抗生素、培养基、缓冲溶液及其配制第35页
            2.2.3.1 抗生素及培养基的配制第35页
            2.2.3.2 缓冲溶液的配制第35页
        2.2.4 土壤样品的采集第35-36页
        2.2.5 土壤样品总DNA的提取第36-37页
        2.2.6 土壤环境中弓形虫卵囊检测所用的寡核苷酸引物第37-38页
        2.2.7 土壤环境中弓形虫卵囊的检测第38-39页
            2.2.7.1 PCR及LAMP扩增体系及条件第38-39页
            2.2.7.2 PCR及LAMP扩增的特异性第39页
            2.2.7.3 PCR及LAMP扩增的敏感性第39页
            2.2.7.4 PCR抑制因子的检测第39页
            2.2.7.5 PCR及LAMP结果的检测方法第39页
        2.2.8 弓形虫阳性土壤样品PCR扩增产物测序鉴定第39-41页
            2.2.8.1 PCR产物的回收第39-40页
            2.2.8.2 外源DNA片段与质粒载体的连接反应第40页
            2.2.8.3 大肠杆菌感受态细胞DH5α的制备(氯化钙法)第40-41页
            2.2.8.4 连接产物的转化第41页
            2.2.8.5 菌液PCR鉴定第41页
        2.2.9 土壤环境中弓形虫卵囊检测方法的临床应用第41页
        2.2.10 统计学分析第41页
    2.3 结果与分析第41-48页
        2.3.1 弓形虫阳性样品PCR扩增产物测序鉴定结果第41-42页
        2.3.2 PCR以及LAMP方法的特异性第42-43页
        2.3.3 PCR以及LAMP方法的敏感性第43页
        2.3.4 PCR抑制因子的检测第43-44页
        2.3.5 PCR以及LAMP扩增的临床应用第44-48页
            2.3.5.1 武汉市公园土壤样品弓形虫卵囊检测结果第44-46页
            2.3.5.2 猪场土壤样品弓形虫卵囊检测结果第46-47页
            2.3.5.3 校园土壤样品弓形虫卵囊检测结果第47-48页
    2.4 讨论第48-51页
第三章 土壤环境细菌性污染的调查和大肠杆菌消毒剂的筛选第51-95页
    3.1 研究的目的与意义第51-52页
    3.2 材料与方法第52-64页
        3.2.1 菌株和载体第52页
        3.2.2 主要试剂第52页
        3.2.3 消毒剂第52-53页
        3.2.4 主要试剂及溶液的配制第53-54页
            3.2.4.1 培养基的配制第53-54页
            3.2.4.2 消毒剂筛选使用溶液第54页
            3.2.4.3 高效液相色谱检测所需溶液的配制第54页
        3.2.5 主要仪器设备第54-55页
        3.2.6 试验土壤样品的采集第55页
            3.2.6.1 土壤细菌性污染调查样品的采集第55页
            3.2.6.2 消毒剂筛选土壤样品的采集第55页
        3.2.7 土壤环境中大肠杆菌PCR检测所用的寡核苷酸引物第55页
        3.2.8 土壤环境中细菌性污染调查方法第55-57页
            3.2.8.1 土壤中细菌总数的测定第56页
            3.2.8.2 土壤中粪便污染指示菌的检测与计数第56-57页
        3.2.9 土壤环境中大肠杆菌的消毒剂筛选试验第57-64页
            3.2.9.1 菌悬液的制备第57页
            3.2.9.2 大肠杆菌稀释液的筛选第57页
            3.2.9.3 消毒剂中和剂鉴定试验第57-59页
            3.2.9.4 土壤载体鉴定试验第59-60页
            3.2.9.5 盆栽试验第60-61页
            3.2.9.6 现场模拟试验第61页
            3.2.9.7 戊二醛在土壤中的消解测定第61-64页
    3.3 结果与分析第64-88页
        3.3.1 土壤环境中细菌性污染调查第64-67页
            3.3.1.1 土壤环境中细菌总数的测定第65页
            3.3.1.2 土壤中粪便污染指示菌检测与计数第65-67页
        3.3.2 土壤环境中大肠杆菌的消毒剂筛选试验第67-88页
            3.3.2.1 大肠杆菌稀释液的筛选第67-68页
            3.3.2.2 化学消毒剂中和剂的鉴定第68页
            3.3.2.3 土壤载体试验第68-72页
            3.3.2.4 盆栽试验第72-79页
            3.3.2.5 现场模拟试验第79-80页
            3.3.2.6 戊二醛在土壤中的消解测定第80-88页
    3.4 讨论第88-95页
        3.4.1 猪场土壤环境中细菌性污染的调查第88-90页
        3.4.2 土壤环境中大肠杆菌消毒剂的筛选第90-95页
            3.4.2.1 大肠杆菌稀释液的筛选第90页
            3.4.2.2 消毒剂中和剂的鉴定试验第90-91页
            3.4.2.3 土壤中大肠杆菌消毒剂的筛选第91-93页
            3.4.2.4 戊二醛对土壤的安全性评价第93-95页
结论第95-96页
参考文献第96-110页
附录第110-111页
致谢第111页
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