鸡miR-1666前体区SNP对其成熟体生成和其靶基因调控的影响
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论文详情
| 致谢 | 第4-9页 |
| 摘要 | 第9-10页 |
| 1 文献综述 | 第10-18页 |
| 1.1 mi RNA的研究进展 | 第10-14页 |
| 1.1.1 mi RNAs的加工过程综述 | 第10-11页 |
| 1.1.2 mi RNA调控基因表达的机制 | 第11-12页 |
| 1.1.3 mi RNAs生物学功能研究 | 第12-14页 |
| 1.2 mi RNA相关的研究方法 | 第14-15页 |
| 1.2.1 新mi RNA的发现与鉴定 | 第14页 |
| 1.2.2 mi RNA靶基因的筛选与鉴定 | 第14-15页 |
| 1.2.3 mi RNA的定量 | 第15页 |
| 1.3 mi RNA SNP的研究进展 | 第15-18页 |
| 1.3.1 SNP影响mi RNA的加工过程 | 第16页 |
| 1.3.2 SNP影响mi RNA对靶基因表达的调控 | 第16-17页 |
| 1.3.3 SNP与疾病 | 第17页 |
| 1.3.4 SNP对动物经济性状的影响 | 第17-18页 |
| 2 引言 | 第18-19页 |
| 3 固始鸡-安卡鸡F2代资源群mi R-1666基因前体区遗传变异的研究 | 第19-31页 |
| 3.1 试验材料 | 第19-20页 |
| 3.1.1 试验动物 | 第19页 |
| 3.1.2 试验主要试剂及配制 | 第19-20页 |
| 3.1.3 主要仪器设备 | 第20页 |
| 3.2 试验方法 | 第20-22页 |
| 3.2.1 基因组DNA的提取及混池构建 | 第20-21页 |
| 3.2.2 SNP的检测与鉴定 | 第21页 |
| 3.2.3 PCR-RFLP法基因分型 | 第21-22页 |
| 3.3 数据统计与分析 | 第22-23页 |
| 3.3.1 基因型频率与基因频率的统计 | 第22页 |
| 3.3.2 SNP基因型与资源群表型性状关联分析模型 | 第22-23页 |
| 3.4 结果与分析 | 第23-28页 |
| 3.4.1 SNP的鉴定 | 第23页 |
| 3.4.2 鸡mi R-1666基因前体区rs14120863 SNP分型与测序验证 | 第23-24页 |
| 3.4.3 鸡mi R-1666基因突变位点基因型频率与基因频率统计 | 第24页 |
| 3.4.5 鸡mi R-1666基因rs14120863位点不同基因型与表型性状的关联分析 | 第24-28页 |
| 3.5 讨论 | 第28-30页 |
| 3.6 小结 | 第30-31页 |
| 4 鸡mi R-1666前体区SNP对其成熟体生成的影响 | 第31-44页 |
| 4.1 试验材料 | 第31-32页 |
| 4.1.1 细胞系 | 第31页 |
| 4.1.2 载体 | 第31页 |
| 4.1.3 主要仪器 | 第31页 |
| 4.1.4 主要试验试剂及溶液配制 | 第31-32页 |
| 4.2 试验方法 | 第32-39页 |
| 4.2.1 mi R-1666不同等位基因二级结构预测 | 第32页 |
| 4.2.2 mi R-1666不同等位基因表达载体构建与鉴定 | 第32-35页 |
| 4.2.3 细胞培养 | 第35-36页 |
| 4.2.4 细胞转染 | 第36页 |
| 4.2.5 成熟mi R-1666荧光定量 | 第36-38页 |
| 4.2.6 数据分析 | 第38-39页 |
| 4.3 结果与分析 | 第39-42页 |
| 4.3.1 mi R-1666前体区SNP对其二级结构的影响 | 第39页 |
| 4.3.2 mi R-1666不同等位基因表达载体的构建和鉴定 | 第39-40页 |
| 4.3.3 细胞转染 | 第40页 |
| 4.3.4 RNA提取后质量检测 | 第40-41页 |
| 4.3.5 成熟mi R-1666表达量的检测 | 第41-42页 |
| 4.4 讨论 | 第42-43页 |
| 4.5 小结 | 第43-44页 |
| 5 鸡mi R-1666前体区SNP对其靶基因调控的影响 | 第44-53页 |
| 5.1 试验材料 | 第44-45页 |
| 5.1.1 细胞系 | 第44页 |
| 5.1.2 载体 | 第44页 |
| 5.1.3 主要仪器 | 第44页 |
| 5.1.4 主要试验试剂及溶液配制 | 第44-45页 |
| 5.2 试验方法 | 第45-48页 |
| 5.2.1 mi RNA靶基因的预测分析 | 第45页 |
| 5.2.2 mi RNA候选靶基因的筛选 | 第45页 |
| 5.2.3 候选靶序列psi CHECK-2 载体构建 | 第45-47页 |
| 5.2.4 细胞培养 | 第47页 |
| 5.2.5 共转染及双荧光素酶报告基因活性检测 | 第47-48页 |
| 5.2.6 数据分析 | 第48页 |
| 5.3 结果与分析 | 第48-52页 |
| 5.3.1 mi R-1666靶基因的预测 | 第48页 |
| 5.3.2 候选靶基因的筛选 | 第48-50页 |
| 5.3.3 候选靶基因的验证 | 第50-51页 |
| 5.3.4 mi R-1666前体区SNP对靶基因CBFB调控的影响 | 第51-52页 |
| 5.4 讨论 | 第52页 |
| 5.5 小结 | 第52-53页 |
| 6 全文总结 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-64页 |
| ABSTRACT | 第64-65页 |
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