类芽孢杆菌B69羊毛硫抗生素elgicins的分离鉴定及相关基因簇的分析

类芽孢杆菌论文 非核糖体肽合成酶论文 聚酮合成酶论文 羊毛硫抗生素论文
论文详情
羊毛硫抗生素是一类结构独特的肽类抗生素,因其序列中含有羊毛硫类非常规氨基酸而得名。羊毛硫抗生素生物活性多样、结构稳定、抗菌靶位特别且不易产生耐药性,因此,在食品、医药领域具有广泛的应用前景。尽管羊毛硫抗生素的前体是通过核糖体途径合成的,但是其成熟的活性肽需要经过复杂的翻译后加工才能形成。基于此,新羊毛硫抗生素的发现及其生物合成机理已成为人们研究的热点之一。类芽孢杆菌B69是本实验室从土壤样品中分离到的一株具有潜在应用价值的生物防治菌。通过已完成的基因组草图分析发现,B69基因组中至少存在一个非核糖体肽合成酶(nonribosomal peptide synthetase, NRPS)基因簇,一个聚酮合成酶(polyketide synthase, PKS)基因簇,三个杂合的PKS/NRPS基因簇及一个全新的羊毛硫抗生素合成基因簇(elg)。本文重点描述以elg基因簇为指导发现的四种新型羊毛硫抗生素。elg基因簇含有5个开放阅读框(elgTl、elgC、elgT2、elgB和elgA)。elgA是编码前体的结构基因,elgB和elgC是编码翻译后的修饰基因,而elgTl和elgT2则是编码转运蛋白有关的基因。利用不同发酵培养基培养B69,发现KL培养基可以诱导elg基因簇表达。将发酵上清通过大孔吸附树脂、固相萃取以及制备型反向高效液相色谱三步分离纯化,最后获得3个组份,分别命名为elgicin A、elgicin B和elgicin C,其中elgicin B的含量最高。进一步分析发现elgicin A是两个不同组份的混合物,分别命名为elgicin AI和elgicin AⅡ。经质谱测定,ElgicinAⅠ、AⅡ、B和C四种化合物的相对分子质量分别是4536、4593、4706和4820Da。其中elgicin All的分子量比A1大57,elgicin B的分子量比AⅡ大113,而elgicinC的分子量比B大114,和氨基酸Gly、Ile/Leu、Asn等残基的分子量完全匹配,暗示它们可能来源于同一前体蛋白。Edman氨基酸序列分析表明,Elgicin B的N-末端氨基酸组成为Leu-Gly-Asp-Tyr,这和elgA基因编码的前体蛋白部分序列相一致,表明elgicin B是elgA的编码产物。结合elgicin AⅠ、elgicinⅡ和elgicin C的质谱结果,我们推断这4种多肽均来源于同一个前体肽,也就是ElgA。由一个前体肽经翻译后加工成四种羊毛硫抗生素,此至目前尚未见报道。故elgicins的生物合成机理值得进一步深入研究。体外活性分析表明elgicins对革兰氏阳性和阴性菌株均具有一定的的抑制作用。
致谢第7-8页
英文缩略词第8-9页
摘要第9-11页
Abstract第11-12页
第一章 B69基因组有关次级代谢产物合成基因簇的挖掘第13-22页
    1.1 前言第13-14页
    1.2 方法第14页
        1.2.1 本地Blast检索第14页
    1.3 结果与讨论第14-22页
        1.3.1 nrp基因簇概况分析第14-16页
        1.3.2 pks基因簇概况分析第16-17页
        1.3.3 nps基因簇概况分析第17-18页
        1.3.4 npn基因簇概况分析第18-19页
        1.3.5 npq基因簇概况分析第19-20页
        1.3.6 elg基因簇概况分析第20-22页
第二章 羊毛硫抗生素基因簇功能分析以及产物结构解析第22-48页
    2.1 前言第22-23页
    2.2 材料第23-26页
        2.2.1 菌株第23-24页
        2.2.2 主要试剂第24页
        2.2.3 培养基的配置第24-25页
        2.2.4 主要仪器第25-26页
    2.3 方法第26-28页
        2.3.1 本地Blast检索第26页
        2.3.2 氨基酸序列比对第26页
        2.3.3 最佳培养基的选择第26页
        2.3.4 抗生素抗菌活性测定第26页
        2.3.5 发酵工艺流程第26-27页
        2.3.6 抗生素的分离纯化第27页
            2.3.6.1 粗提物的制备第27页
            2.3.6.2 初步分离纯化第27页
            2.3.6.3 反向HPLC分离纯化第27页
        2.3.7 质谱分析第27-28页
        2.3.8 蛋白质氨基末端测序第28页
        2.3.9 基因簇序列上传第28页
    2.4 结果第28-42页
        2.4.1 生物信息学分析结果第28-31页
        2.4.2 培养基筛选第31页
        2.4.3 大孔吸附柱层析第31页
        2.4.4 SPE固相萃取第31页
        2.4.5 反向HPLC分离纯化第31-32页
        2.4.6 质谱分析第32-34页
        2.4.7 蛋白质末端测序第34-36页
        2.4.8 elgicins的体外抗菌活性第36页
        2.4.9 基因簇序列上传第36-42页
    2.5 讨论第42-48页
        2.5.1 elg基因簇生物学分析第42-43页
        2.5.2 培养基选择第43-44页
        2.5.3 elgcins的分离纯化第44页
        2.5.4 elgicins质谱分析第44-45页
        2.5.5 elgicin B的N-末端测序第45页
        2.5.6 羊毛硫抗生素的抗菌机制第45-48页
参考文献第48-57页
文献综述第57-79页
    参考文献第69-79页
作者简历第79-80页
论文购买
论文编号ABS629991,这篇论文共80页
会员购买按0.30元/页下载,共需支付24
不是会员,注册会员
会员更优惠充值送钱
直接购买按0.5元/页下载,共需要支付40
只需这篇论文,无需注册!
直接网上支付,方便快捷!
相关论文

点击收藏 | 在线购卡 | 站内搜索 | 网站地图
版权所有 艾博士论文 Copyright(C) All Rights Reserved
版权申明:本文摘要目录由会员***投稿,艾博士论文编辑,如作者需要删除论文目录请通过QQ告知我们,承诺24小时内删除。
联系方式: QQ:277865656