| 中文摘要 | 第4-7页 |
| 英文摘要 | 第7页 |
| 目录 | 第11-14页 |
| 1.引言 | 第14-47页 |
| 1.1 小RNA的种类 | 第14-33页 |
| 1.1.1 干扰小RNA | 第14-24页 |
| 1.1.1.1 siRNA的发现 | 第14-16页 |
| 1.1.1.2 siRNA介导RNA干扰的分子机制 | 第16页 |
| 1.1.1.3 siRNA的功能 | 第16-18页 |
| 1.1.1.4 RNAi技术的应用 | 第18-24页 |
| 1.1.1.4.1 siRNA的设计 | 第18页 |
| 1.1.1.4.2 siRNA的合成 | 第18-22页 |
| 1.1.1.4.3 RNA干扰技术的利用 | 第22-24页 |
| 1.1.2 microRNA(miRNA) | 第24-32页 |
| 1.1.2.1 miRNA的发现及其特性 | 第24-25页 |
| 1.1.2.2 miRNA基因鉴定及其表达标准 | 第25-26页 |
| 1.1.2.3 miRNA的克隆 | 第26-27页 |
| 1.1.2.4 miRNA转录成熟 | 第27-28页 |
| 1.1.2.5 miRNA的作用机制 | 第28页 |
| 1.1.2.6 动物和植物中的miRNA | 第28-29页 |
| 1.1.2.7 siRNA和miRNA的比较 | 第29页 |
| 1.1.2.8 miRNA目标预测 | 第29-30页 |
| 1.1.2.9 miRNA生物学功能 | 第30-32页 |
| 1.1.2.9.1 动物中miRNA | 第30-32页 |
| 1.1.2.9.2 植物中miRNA的功能 | 第32页 |
| 1.1.3 微小非编码RNA(tncRNA) | 第32-33页 |
| 1.1.4 调节性小双链RNA(smRNAs) | 第33页 |
| 1.1.5 Trans-acting siRNA(tasiRNA) | 第33页 |
| 1.2 与微小RNA生物产生及其功能发生相关的部分蛋白 | 第33-41页 |
| 1.2.1 核糖核酸酶Ⅲ超家族 | 第33-37页 |
| 1.2.1.1 细菌核糖核酸酶Ⅲ | 第34-35页 |
| 1.2.1.1.1 细菌核糖核酸酶Ⅲ功能 | 第34-35页 |
| 1.2.1.2 酵母核糖核酸酶Ⅲ | 第35页 |
| 1.2.1.3 高等真核生物核糖核酸酶Ⅲ | 第35-37页 |
| 1.2.1.3.1 DICER | 第36-37页 |
| 1.2.1.3.2 Drosha | 第37页 |
| 1.2.2 Argonaute家族蛋白 | 第37-39页 |
| 1.2.3 RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp) | 第39-41页 |
| 1.2.4 RNA聚合酶Ⅳ(RNA polymerase Ⅳ) | 第41页 |
| 1.2.5 RISC(RNA iducing silence complex) | 第41页 |
| 1.3 水稻基因组计划及其生物信息学 | 第41-44页 |
| 1.3.1 水稻基因组计划的概况 | 第42-44页 |
| 1.3.2 水稻生物信息学 | 第44页 |
| 1.4 本研究的目的与意义 | 第44-47页 |
| 2.材料与方法 | 第47-60页 |
| 2.1 材料种植和准备 | 第47页 |
| 2.2 总RNA的提取 | 第47-48页 |
| 2.3 阴离子交换层析分离小片段RNA | 第48页 |
| 2.4 变性聚丙烯酰胺(PAGE)凝胶分离小RNA片段 | 第48-51页 |
| 2.5 小RNA的克隆 | 第51-54页 |
| 2.6 小RNA片段分析 | 第54页 |
| 2.7 小RNA在染色体的分布 | 第54页 |
| 2.8 Northen blot杂交 | 第54-56页 |
| 2.9 快速扩增cDNA末端(RACE) | 第56-57页 |
| 2.10 Dicer-like全长cDNA的获得 | 第57-58页 |
| 2.11 Dicer-like基因的克隆 | 第58-60页 |
| 3.结果与分析 | 第60-86页 |
| 3.1 水稻中小RNA | 第60-64页 |
| 3.1.1 水稻小RNA群体 | 第60-62页 |
| 3.1.2 小RNA在水稻9311染色体位置分布 | 第62页 |
| 3.1.3 部分重叠小RNA | 第62-63页 |
| 3.1.4 小RNA簇 | 第63-64页 |
| 3.2 水稻中的miRNA | 第64-74页 |
| 3.2.1 水稻中17个miRNA | 第64-67页 |
| 3.2.2 前体和microRNA长度的多样性 | 第67-68页 |
| 3.2.3 miRNA在基因组中的位置 | 第68页 |
| 3.2.4 miRNA的目标 | 第68-70页 |
| 3.2.5 m29作用目标克隆 | 第70-74页 |
| 3.2.6 小RNA附近的茎环结构 | 第74页 |
| 3.3 与重复序列相关的小干扰RNA(rasiRNAs) | 第74-76页 |
| 3.4 微小非编码RNA | 第76页 |
| 3.5 水稻中的RNase Ⅲ以及Dicer-like基因 | 第76-86页 |
| 3.5.1 水稻中的RNase Ⅲ家族 | 第76-79页 |
| 3.5.2 籼稻中一个Dicer-like基因 | 第79-84页 |
| 3.5.3 Dicer-like基因的表达 | 第84-86页 |
| 4.讨论 | 第86-95页 |
| 4.1 植物中微小RNA多样性 | 第86-88页 |
| 4.2 microRNA及其功能 | 第88-89页 |
| 4.3 siRNA和rasiRNA | 第89页 |
| 4.4 小RNA与逆境 | 第89-90页 |
| 4.5 小RNA与看家非编码RNA | 第90-91页 |
| 4.6 小RNA与花药中小孢子发育 | 第91-92页 |
| 4.7 小RNA研究的方法与策略 | 第92-93页 |
| 4.8 植物中DCL(Dicer-like) | 第93-95页 |
| 结论 | 第95-97页 |
| 参考文献 | 第97-115页 |
| 附录Ⅰ | 第115-135页 |
| 附录Ⅱ 英文缩写 | 第135-136页 |
| 在读期间发表的论文 | 第136-137页 |
| 致谢 | 第137页 |
