肺癌CIRCRNA生物信息学分析与数据库开发

circRNA论文 肺癌论文 数据库论文 RNA-seq论文
论文详情
摘要第6-8页
Abstract第8-9页
缩略词表第10-11页
1 前言第11-34页
    1.1 circRNA简介第11-27页
        1.1.1 circRNA的研究历程第12页
        1.1.2 circRNA的特征第12-14页
        1.1.3 circRNA的分类第14-15页
        1.1.4 circRNA的形成机制第15-18页
        1.1.5 circRNA的生物学功能第18-20页
        1.1.6 circRNA与人类疾病第20-21页
        1.1.7 circRNA相关数据库第21-23页
        1.1.8 circRNA鉴别软件第23-27页
    1.2 癌症简介第27-32页
        1.2.1 肺癌的发病诱因第28-29页
        1.2.2 肺癌的类型第29页
        1.2.3 癌症与circRNA第29-32页
        1.2.4 癌症相关数据库第32页
    1.3 研究目的与意义第32-34页
2 材料与方法第34-42页
    2.1 相关数据第34-38页
        2.1.1 RNA-seq数据第34-35页
        2.1.2 基因组及相关注释信息第35-36页
        2.1.3 相关软件及下载链接第36-38页
    2.2 数据分析流程第38-42页
        2.2.1 原始数据预处理第38页
        2.2.2 circRNA鉴别第38-40页
        2.2.3 数据的统计分析第40页
        2.2.4 GO与KEGG富集分析第40-41页
        2.2.5 检索现有的数据库第41页
        2.2.6 数据库以及网站的构建第41-42页
3 结果与分析第42-60页
    3.1 circRNA分析结果第42-44页
        3.1.1 circRNA鉴别结果第42-44页
        3.1.2 circRNA与数据库重叠情况第44页
    3.2 hostgene注释第44-52页
        3.2.1 相关hostgene的GO分析第46-47页
        3.2.2 相关hostgene的KEGG通路富集分析第47-49页
        3.2.3 肺癌相关的hostgene第49-50页
        3.2.4 circRNA-miRNA互作网络第50-52页
    3.3 circRNA结构特征第52-57页
        3.3.1 circRNA的染色体分布第52-53页
        3.3.2 circRNA基因组长度分析第53页
        3.3.3 circRNA―热点‖分析第53-57页
    3.4 肺癌circRNA数据库开发第57-60页
        3.4.1 整体设计思路第57页
        3.4.2 数据库构建第57-58页
        3.4.3 网页设计第58-60页
4 总结与讨论第60-62页
5 展望第62-64页
参考文献第64-78页
附录第78-84页
致谢第84页
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