大豆ERF转录因子GmERF6和GmERF7的克隆与功能鉴定

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大豆是重要的粮食和经济作物,不仅是人类蛋白和脂类的主要来源,同时也是重要的家畜饲料和工业原料。然而病害、干旱、低温和土壤盐渍化等不良环境因子严重影响了大豆的生长发育,给大豆生产造成了巨大损失。研究表明,ERF转录因子在植物应对生物及非生物胁迫反应,调控胁迫相关功能基因的表达,提高植物的抗逆性中起着重要的作用。本研究从大豆(吉林32)中克隆了2个新的ERF转录因子,即GmERF6和GmERF7,并对它们进行结构分析和功能鉴定,研究其调控机制,以期为GmERF6和GmERF7转录因子的进一步应用提供理论基础,并丰富大豆ERF转录因子基因资源。具体实验结果如下:1.采用RT-PCR方法从大豆品种吉林32中分离出两个新的ERF转录因子基因。GmERF6的ORF全长582bp,编码260个氨基酸,包含一个AP2/ERF结合域,两个预测的核定位信号和一个EAR抑制元件,预测其在细胞核中起转录抑制作用;GmERF7的ORF全长1179bp,编码392个氨基酸,包含一个AP2/ERF结合域,两个预测的核定位信号,一个预测的转录激活域和一个MCGGAI(I/L)元件,预测其在细胞核中起转录激活作用。氨基酸序列比对和进化树分析结果表明:GmERF6被划分到ERF转录因子亚家族的第II亚类,与大豆中的GmERF4的亲缘关系最近,推测它们可能存在共同的起源;GmERF7被划分到ERF转录因子亚家族的第IV亚类,与大豆中的GmERF3的亲缘关系最近,推测它们可能存在共同的起源。2.分别构建了GmERF6和GmERF7的绿色荧光蛋白融合表达载体,利用农杆菌介导的洋葱表皮细胞遗传转化进行亚细胞定位。证明GmERF6蛋白和GmERF7蛋白均定位于细胞核中。3.将GmERF6和GmERF7在酵母系统中的表达。结果表明,GmERF6在酵母中不具有转录激活功能,而GmERF7具转录激活功能,属于转录激活子。4.将GmERF6和GmERF7在原核系统中表达,对重组蛋白纯化后进行凝胶阻滞分析。结果表明,GmERF6蛋白和GmERF7蛋白在体外均可以与GCC-box元件特异结合。5.在烟草叶片中对GmERF6和GmERF7的转录调节活性进行瞬时表达分析。结果表明,GmERF6在体内具有转录抑制活性,不仅可以抑制下游目的基因的表达,还可以抑制其他转录激活子的激活活性;GmERF7在体内具有转录激活活性,可以激活下游基因的表达。6.利用实时荧光定量PCR对GmERF6和GmERF7基因的组织表达特性和逆境诱导表达特性进行分析。结果表明,GmERF6和GmERF7在各组织中均有表达,不具有组织特异表达性,但它们在根部表达量明显高于其他组织。GmERF6和GmERF7对干旱、高盐、低温、机械伤害、ABA、ET、SA和MeJA八种生物及非生物胁迫处理均存在不同程度的应答响应。7.通过PCR分别从大豆吉林32的DNA中扩增得到1986bp的GmERF6启动子序列(GmERF6P)和1963bp的GmERF7启动子序列(GmERF7P),并发现它们含有多种与逆境相关的顺式作用元件。将GmERF6P和GmERF7P在烟草叶片中进行瞬时表达。结果表明,GmERF6P和GmERF7P具有较弱的启动活性。干旱、高盐、低温、ET、GA和ABA处理10h诱导GmERF6P的启动活性不同程度的增强;干旱、高盐、ET和GA处理10h诱导GmERF7P的启动活性不同程度的增强,但低温和ABA处理10h降低了GmERF7P的启动活性。将GmERF6P与GmERF6基因共同转化烟草叶片进行瞬时表达后GmERF6P的启动活性被抑制,证明GmERF6基因的表达存在着反馈抑制作用。8.将GmERF6构建到植物表达载体pBI121上转化拟南芥。利用半定量RT-PCR方法对T3代GmERF6转基因拟南芥中的抗逆相关基因的表达情况进行检测。结果表明,在转基因拟南芥中,AtKin1、AtSOS1、AtPR3、AtRD22、AtERF4、AtERF7和AtNIMIN1的表达量明显下降,AtPDF1.2和AtPR4的表达量明显上升。干旱胁迫下GmERF6转因拟南芥种子萌发率显著高于野生型种子萌发率;断水处理18d后GmERF6转基因拟南芥长势好于野生型拟南芥;GmERF6转基因拟南芥离体的脱水率低于野生型拟南芥离体的脱水率。以上结果表明,GmERF6提高了转基因拟南芥的抗旱能力。9.将GmERF7构建到植物表达载体pBI121上转化拟南芥和烟草。利用半定量RT-PCR方法对T3代GmERF7转基因拟南芥中的抗逆相关基因的表达情况进行检测。结果表明,在转基因拟南芥中,AtKin1和AtRD29A的表达量明显升高。高盐胁迫下GmERF7转因拟南芥种子萌发率显著高于野生型种子萌发率。高盐胁迫下GmERF7转基因烟草长势好于野生型烟草;GmERF7转基因烟草植株在高盐胁迫下可维持较高的叶绿素含量,降低丙二醛的积累并提高可溶性糖的积累。以上结果表明,GmERF7提高了转基因拟南芥和烟草的抗盐能力。
中文摘要第4-7页
Abstract第7-10页
中英文缩略语表第11-18页
第1章 文献综述第18-34页
    1.1 植物抗逆相关转录因子的研究进展第18-24页
        1.1.1 AP2/ERF 类转录因子第19-20页
        1.1.2 bZIP 类转录因子第20-22页
        1.1.3 MYB 类转录因子第22-23页
        1.1.4 WRKY 类转录因子第23页
        1.1.5 NAC 类转录因子第23-24页
    1.2 ERF 转录因子的研究进展第24-31页
        1.2.1 ERF 转录因子的结构特征和分类第24-26页
        1.2.2 ERF 转录因子的功能特性第26-27页
        1.2.3 ERF 转录因子在植物逆境胁迫信号转导途径中的作用第27-29页
        1.2.4 ERF 转录因子在植物抗逆性改良上的应用第29-30页
        1.2.5 大豆中的 ERF 转录因子第30-31页
    1.3 植物转录因子的研究方法第31-33页
        1.3.1 植物转录因子的瞬间转化表达分析第31-32页
        1.3.2 植物转录因子的功能突变分析第32-33页
    1.4 本研究的目的与意义第33-34页
第2章 GmERF6 和 GmERF7 的克隆及序列分析第34-46页
    2.1 材料第34-35页
        2.1.1 植物材料第34页
        2.1.2 宿主菌及载体第34页
        2.1.3 酶及试剂第34页
        2.1.4 引物及测序第34-35页
        2.1.5 主要仪器设备第35页
    2.2 方法第35-38页
        2.2.1 RNA 提取及 cDNA 合成第35-36页
        2.2.2 GmERF6 和 GmERF7 的 PCR 扩增第36页
        2.2.3 PCR 产物的回收第36-37页
        2.2.4 大肠杆菌 DH5α感受态细胞的制备第37页
        2.2.5 PCR 产物的克隆第37-38页
        2.2.6 冻融法转化大肠杆菌 DH5α感受态细胞第38页
        2.2.7 GmERF6 和 GmERF7 序列的生物信息学分析第38页
    2.3 结果第38-44页
        2.3.1 GmERF6 和 GmERF7 基因 cDNA 全长序列的获得第38-39页
        2.3.2 GmERF6 和 GmERF7 基因的序列特征分析及编码蛋白的结构功能预测第39-42页
        2.3.3 GmERF6 和 GmERF7 基因保守域同源性及进化树分析第42-44页
    2.4 讨论第44页
    2.5 小结第44-46页
第3章 GmERF6 和 GmERF7 功能的初步分析第46-74页
    3.1 材料第46-48页
        3.1.1 植物材料第46页
        3.1.2 宿主菌及载体第46页
        3.1.3 酶及试剂第46页
        3.1.4 引物及测序第46-48页
        3.1.5 主要仪器设备第48页
    3.2 方法第48-57页
        3.2.1 亚细胞定位载体、酵母单杂交载体和原核表达载体的构建第48-49页
        3.2.2 亚细胞定位第49-50页
        3.2.3 酵母单杂交第50-51页
        3.2.4 蛋白纯化及 EMSA第51-53页
        3.2.5 GmERF6 和 GmERF7 转录调节活性分析第53-56页
        3.2.6 GmERF6 和 GmERF7 的表达模式分析第56-57页
    3.3 结果第57-71页
        3.3.1 GmERF6 和 GmERF7 的亚细胞定位第57-58页
        3.3.2 GmERF6 和 GmERF7 在酵母中的转录激活活性验证第58-60页
        3.3.3 GmERF6 和 GmERF7 蛋白与 GCC-box 的体外结合第60-64页
        3.3.4 GmERF6 和 GmERF7 转录调节活性分析第64-67页
        3.3.5 GmERF6 和 GmERF7 的表达模式分析第67-71页
    3.4 讨论第71-73页
    3.5 小结第73-74页
第4章 GmERF6 和 GmERF7 启动子的克隆及瞬时表达分析第74-88页
    4.1 材料第74-75页
        4.1.1 植物材料第74页
        4.1.2 宿主菌及载体第74页
        4.1.3 酶及试剂第74页
        4.1.4 引物及测序第74-75页
        4.1.5 主要仪器设备第75页
    4.2 方法第75-76页
        4.2.1 大豆基因组 DNA 的提取第75页
        4.2.2 GmERF6 和 GmERF7 基因启动子的克隆第75页
        4.2.3 GmERF6P 和 GmERF7P 顺式作用元件预测与分析第75页
        4.2.4 表达载体的构建及农杆菌转化第75-76页
        4.2.5 烟草叶片的转化及胁迫处理第76页
        4.2.6 组织化学染色第76页
        4.2.7 GUS 荧光定量第76页
    4.3 结果第76-85页
        4.3.1 GmERF6 和 GmERF7 基因启动子序列的获得第76-77页
        4.3.2 GmERF6P 和 GmERF7P 序列顺式作用元件的预测与分析第77-81页
        4.3.3 瞬时表达载体的构建及农杆菌转化第81页
        4.3.4 GmERF6P 和 GmERF7P 逆境诱导瞬时表达第81-84页
        4.3.5 GmERF6 对 GmERF6P 启动活性的反馈调控第84-85页
    4.4 讨论第85-87页
    4.5 小结第87-88页
第5章 GmERF6 在拟南芥中的表达及抗旱性分析第88-100页
    5.1 材料第88-90页
        5.1.1 植物材料第88页
        5.1.2 宿主菌及载体第88页
        5.1.3 酶及试剂第88页
        5.1.4 引物及测序第88-89页
        5.1.5 主要仪器设备第89-90页
    5.2 方法第90-92页
        5.2.1 拟南芥遗传转化第90页
        5.2.2 转基因拟南芥的筛选及鉴定第90-91页
        5.2.3 T3代转基因拟南芥抗逆相关基因的半定量 RT-PCR第91页
        5.2.4 拟南芥中抗逆相关基因启动子顺式作用元件预测分析第91-92页
        5.2.5 T3 代 GmERF6 转基因拟南芥的抗旱性鉴定第92页
    5.3 结果第92-98页
        5.3.1 GmERF6 转基因拟南芥植株的筛选及检测第92-94页
        5.3.2 T3代 GmERF6 转基因拟南芥中抗逆相关基因的表达第94-96页
        5.3.3 T3代 GmERF6 转基因拟南芥的抗旱性分析第96-98页
    5.4 讨论第98-99页
    5.5 小结第99-100页
第6章 GmERF7 在拟南芥和烟草中的表达及抗盐性分析第100-118页
    6.1 材料第100-101页
        6.1.1 植物材料第100页
        6.1.2 宿主菌及载体第100页
        6.1.3 酶及试剂第100页
        6.1.4 引物及测序第100-101页
        6.1.5 主要仪器设备第101页
    6.2 方法第101-104页
        6.2.1 拟南芥遗传转化第101页
        6.2.2 转基因拟南芥的筛选及鉴定第101页
        6.2.3 GmERF7 下游基因半定量 RT-PCR第101页
        6.2.4 拟南芥中抗逆相关基因启动子顺式作用元件预测分析第101页
        6.2.5 T_3代 GmERF7 转基因拟南芥高盐胁迫条件下萌发率测定第101页
        6.2.6 烟草遗传转化第101-102页
        6.2.7 转基因烟草的筛选及鉴定第102页
        6.2.8 T_1代 GmERF7 转基因烟草的抗盐性鉴定第102-104页
    6.3 结果第104-115页
        6.3.1 GmERF7 转基因拟南芥植株的筛选及检测第104-106页
        6.3.2 T_3代 GmERF7 转基因拟南芥中抗逆相关基因的表达第106-107页
        6.3.3 T_3代 GmERF7 转基因拟南芥高盐胁迫条件下萌发率分析第107-108页
        6.3.4 GmERF7 转基因烟草植株的筛选及检测第108-110页
        6.3.5 T_1代 GmERF7 转基因烟草的抗盐性分析第110-115页
    6.4 讨论第115-116页
    6.5 小结第116-118页
结论第118-120页
参考文献第120-134页
附录第134-140页
作者简介及科研成果第140-141页
致谢第141-142页
论文购买
论文编号ABS551377,这篇论文共142页
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