中国明对虾Rac1/PI3K/Akt通路相关基因的克隆和功能关系的初步研究
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对虾养殖病害的频发给对虾水产养殖业的发展造成了巨大损失。深入开展对虾免疫机制的研究,可为制定有效的病害防治策略、维持对虾养殖业的可持续发展提供理论依据。Toll通路是无脊椎动物抵抗外界病原体感染的重要信号通路。在对中国明对虾转录组数据进行生物信息学分析的基础上找到了由Toll受体所介导的Rac1/PI3K/Akt通路的相关因子Rac1、PI3K以及Akt。Rac1作为一种小分子量GTP结合蛋白,是众多信号通路的重要组成分子,在细胞迁移、细胞增殖、免疫防御、细胞骨架重组等多种生命过程中发挥着重要作用;PI3K和Akt作为Rac1/PI3K/Akt通路中Rac1的下游因子,是细胞内重要的信号传导分子,它们通过参与多种细胞分子反应来实现其重要的生物学功能。本论文克隆了Rac1、PI3K催化亚基和Akt基因的cDNA序列,分析了其推导的氨基酸序列的特征,研究了它们的组织分布,同时研究了它们在应答不同病原刺激时的转录表达变化情况。通过RNAi的方法初步研究了它们之间的功能关系,提示Rac1/PI3K/Akt通路在对虾免疫中的重要作用。具体如下:中国明对虾的Rac1基因(FcRac1)开放阅读框(ORF)为579bp,共编码192个氨基酸,具有保守的RHO结构域。FcRac1蛋白与其他物种的Rac1蛋白具有较高的相似性;系统进化分析表明,FcRac1蛋白在亲缘关系上更接近节肢动物的Rac1蛋白。Real-time PCR分析显示,FcRac1在血细胞中的表达量最高。RNA原位杂交分析表明,FcRac1在不同类型的血细胞中广泛存在。对虾在注射细菌(溶壁微球菌或鳗弧菌)1h后,FcRac1的转录表达显著上调;在注射白斑综合症病毒(WSSV)的3-72h内,FcRac1的转录表达也出现不同程度的变化,说明FcRac1蛋白可能参与了对虾的抗菌或抗病毒免疫。中国明对虾PI3K的催化亚基基因(FcPI3Kc)的ORF为3222bp,编码1073个氨基酸,具有PI3Kc蛋白的五个特征性结构域。FcPI3Kc与其他物种的PI3K催化亚基相似性较高。定量PCR分析发现FcPI3Kc在对虾血细胞中的表达量最高。对虾注射细菌(溶壁微球菌或鳗弧菌)1h时,FcPI3Kc的转录表达显著上调;注射WSSV3小时后, FcPI3Kc在转录水平上出现一定程度的下调表达。中国明对虾蛋白激酶Akt基因(FcAkt)的开放阅读框(ORF)为1536bp,编码511个氨基酸,具有保守的PH结构域、催化功能域及调节结构域。FcAkt与地蟹、果蝇、埃及伊蚊、家蚕等节肢动物的蛋白激酶B(Akt/PKB)的亲缘关系较近。FcAkt的转录表达在不同细菌或WSSV注射后也显示出明显的变化,提示FcAkt可能在对虾的免疫防御中发挥了重要作用。对虾注射不同的细菌后,FcRac1、FcPI3Kc及FcAkt的转录表达均存在明显变化,说明三个基因都在对虾买免疫中起一定作用。在FcRac1被干扰后,FcPI3Kc的转录表达也出现明显下调,而FcAkt的转录表达显著上调,由此确定FcRac1、FcPI3Kc及FcAkt三个基因之间存在一定的相互作用。
致谢 | 第4-6页 |
中文摘要 | 第6-8页 |
Abstract | 第8-9页 |
第一章 文献综述 | 第12-27页 |
1.1 引言 | 第12-13页 |
1.2 甲壳动物的免疫机制 | 第13-15页 |
1.3 对虾免疫通路的相关研究 | 第15-25页 |
1.3.1 Toll通路功能基因的相关研究 | 第16-18页 |
1.3.2 Rac1/PI3K/Akt通路及其功能因子的相关研究 | 第18-25页 |
1.4 研究展望及本研究的目的和意义 | 第25-27页 |
第二章 中国明对虾Rac1 基因的克隆及表达分析 | 第27-57页 |
2.1 实验材料 | 第27-30页 |
2.2 实验方法 | 第30-45页 |
2.3 实验结果 | 第45-54页 |
2.3.1 FcRac1 基因序列及推导氨基酸的序列特征 | 第45-47页 |
2.3.2 FcRac1 mRNA在中国明对虾中的组织分布 | 第47-48页 |
2.3.3 中国明对虾经细菌(溶壁微球菌、鳗弧菌)注射后FcRac1 基因的转录表达变化 | 第48-49页 |
2.3.4 中国明对虾感染WSSV后FcRac1 基因的转录表达变化 | 第49-50页 |
2.3.5 FcRac1 基因的在中国明对虾血细胞中的表达特征 | 第50-51页 |
2.3.6 原核表达体系中FcRac1 重组蛋白的表达、纯化与酶活测定 | 第51-53页 |
2.3.7 真核表达体系中FcRac1 重组蛋白的表达、纯化与酶活测定 | 第53-54页 |
2.4 讨论 | 第54-57页 |
第三章 中国明对虾PI3Kc基因的克隆及转录表达分析 | 第57-69页 |
3.1 实验方法 | 第57-59页 |
3.2 实验结果 | 第59-66页 |
3.2.1 FcPI3Kc基因序列及推导氨基酸的序列特征 | 第59-63页 |
3.2.2 FcPI3Kc mRNA在中国明对虾中的组织分布 | 第63-64页 |
3.2.3 中国明对虾经细菌(溶壁微球菌、鳗弧菌)注射后FcPI3Kc基因的转录表达变化特征 | 第64-65页 |
3.2.4 中国明对虾感染WSSV后FcPI3Kc基因的转录表达变化特征 | 第65-66页 |
3.3 讨论 | 第66-69页 |
第四章 中国明对虾Akt基因的克隆及转录表达分析 | 第69-79页 |
4.1 实验方法 | 第69-71页 |
4.2 实验结果 | 第71-77页 |
4.2.1 FcAkt基因序列及推导氨基酸的序列特征 | 第71-74页 |
4.2.2 FcAkt mRNA在中国明对虾中的组织分布 | 第74-75页 |
4.2.3 中国明对虾经细菌(溶壁微球菌、鳗弧菌)注射后FcAkt基因的转录表达变化特征 | 第75-76页 |
4.2.4 中国明对虾感染WSSV后FcAkt基因的转录表达变化 | 第76-77页 |
4.3 讨论 | 第77-79页 |
第五章 中国明对虾Rac1 与PI3K、Akt基因功能关系的初步研究 | 第79-86页 |
5.1 实验方法 | 第79-81页 |
5.2 实验结果 | 第81-83页 |
5.2.1 FcRac1 dsRNA的干扰效果检测 | 第81-82页 |
5.2.2. FcRac1 dsRNA干扰后FcPI3Kc和FcAkt基因的转录表达变化 | 第82-83页 |
5.3 讨论 | 第83-86页 |
结论 | 第86-87页 |
参考文献 | 第87-101页 |
作者个人简历 | 第101-102页 |
硕士期间发表文章 | 第102页 |
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ABS563971,这篇论文共102页
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