关于Penna模型的几个问题
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Penna模型是基于无性繁殖的种群演化模拟模型,该模型于1995年由巴西人T.J.P.Penna提出。Penna模型是以具有年龄结构的种群为研究对象的,该模型除年龄外还考虑了环境压力、遗传因素、繁殖年龄、繁殖强度及突变等因素,且随着分子生物学的进展,将相应的结果溶入到Penna模型中,使得Penna模型有了很大发展。 Penna模型成功的主要原因之一是它采用了一种适合计算机处理的基于位串的个体表示方法。使得人们可以在微机上进行较大规模的种群演化模拟。Penna模型被广泛应用于研究种群动态的许多问题上,比如鲑鱼的灾难性死亡和阿拉斯加狼群的发展等。 在Penna模型的发展和应用中,基本都延用了Penna模型的死亡机制,从而对死亡率及各死亡原因的比例进行详细分析就是一个必要的工作。另外Penna模型有一个很有趣的性质,就是共同祖先问题,对此本文也进行了讨论。本文结构如下: 第一章中给出了Penna模型的简单介绍及其发展现状。 第二章中给出了研究单种群的数学模型和Penna模型的理论描述。Penna模型的数学理论描述非常复杂,并且由理论得到的结果与实际模拟的结果存在很大差异,这更体现了其作为模拟模型的优势。 在第三章中给出了Penna模型的几个问题,包括Penna模型的死亡率分析、死亡原因分析以及共同祖先问题。并给出一些关于死亡率变化、主要死亡原因和共同祖先存在性及性质的重要结论,包括:过量突变使疾病成为主要死亡原因;任何情况下老死的个体几乎不存在以及只要种群不灭绝则共同祖先必然存在等等。 最后对penna模型仍可以继续深入研究的几个问题提出了看法。
1 引言 | 第6-11页 |
2 单种群数学模型和PENNA模型的均衡解 | 第11-34页 |
2.1 单种群数学模型 | 第11-16页 |
2.1.1 Logistic方程 | 第11-12页 |
2.1.2 考虑收获率的单种群模型 | 第12-13页 |
2.1.3 具有时滞的单种群模型 | 第13-14页 |
2.1.4 离散时间的单种群模型 | 第14-15页 |
2.1.5 具时变环境的单种群模型 | 第15-16页 |
2.2 PENNA模型理论描述和均衡解 | 第16-34页 |
2.2.1 标准Penna模型 | 第16-21页 |
2.2.2 Penna模型的理论描述 | 第21-22页 |
2.2.3 Penna模型的均衡解 | 第22-34页 |
3 关于PENNA模型的几个问题 | 第34-45页 |
3.1 标准PENNA模型的死亡率分析 | 第34-39页 |
3.1.1 死亡率的定义及性质 | 第34-37页 |
3.1.2 死亡率的平均值与各参数的关系 | 第37-39页 |
3.2 标准PENNA模型的死亡原因分析 | 第39-41页 |
3.2.1 最低繁殖年龄的变化对死亡原因的影响 | 第39-40页 |
3.2.2 抗病能力的变化对死亡原因的影响 | 第40页 |
3.2.3 突变率的变化对死亡原因的影响 | 第40-41页 |
3.3 PENNA模型的共同祖先问题 | 第41-45页 |
3.3.1 共同祖先的存在性 | 第41-42页 |
3.3.2 共同祖先的性质 | 第42-45页 |
4 关于PENNA模型有待于研究的问题 | 第45-46页 |
参考文献 | 第46-49页 |
论文发表情况 | 第49-50页 |
致谢 | 第50-52页 |
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