新型交联酶聚体技术及其在蛋白组学与生物催化中的应用

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本文针对交联酶聚体(Cross-linked enzyme aggregates,CLEAs)在制备及应用上的两类缺陷,即制备过程中沉淀步骤酶活损失大,催化大分子底物反应时传质限制严重,分别提出了糖类添加剂改善CLEAs酶活及多孔化CLEAs改性两种制备新方法,并将其应用于分析化学与生物催化领域的三个体系,即蛋白组学分析中的胰蛋白酶酶解过程、青霉素酰化酶酶法合成阿莫西林、木瓜蛋白酶酶法降解壳聚糖制活性低聚糖,具体结果如下:1.采用90%浓度乙醇为沉淀剂,0.075%戊二醛为交联剂,以传统方法制备得到了酶活收率为44%的胰蛋白酶CLEAs;胰蛋白酶CLEAs的最适催化温度(70oC)、最适催化pH(9.0)、热稳定性和储存稳定性,均较游离酶有所提高;CLEAs“脚手架”状微观形貌决定了其优良的稳定性和高催化活性。2.将胰蛋白酶CLEAs用于蛋白组学的酶解肽谱分析中,有效防止了高酶浓度下胰蛋白酶的自水解;同时结合高温辅助酶解、超声辅助酶解可实现高通量肽谱解析,分别缩短酶解时间至60min和60s,显著提高了分析通量和序列覆盖度。3.针对传统青霉素酰化酶CLEAs制备过程中沉淀步骤酶活损失大的缺陷,设计了在有机沉淀步骤加入糖类添加剂以提高最终CLEAs酶活的新技术,得到酶活收率为79.3%的青霉素酰化酶CLEAs,比传统制备工艺酶活提高30%;揭示了糖类添加剂(如海藻糖)以“水替代”方式与酶蛋白结合,起到维持酶蛋白天然结构,保持CLEAs活性的作用机理。4.将糖类添加剂改善的青霉素酰化酶CLEAs应用于抗生素阿莫西林的酶法合成反应中,考察了CLEAs对阿莫西林合成收率和选择性的影响;引入30%甲醇介质体系并在高底物比条件下反应,阿莫西林收率可达57%。5.针对传统方式制备的木瓜蛋白酶CLEAs在催化大分子底物反应时效率低的问题,提出以淀粉为致孔剂,在CLEAs内部形成孔隙结构,制成多孔化CLEAs(p-CLEAs)的改进技术;将p-CLEAs应用于大分子蛋白底物牛血清白蛋白和乳清蛋白时,酶解效率分别提高了95.9%和90.4%;证明了p-CLEAs优良的催化效果源于其多孔化的内部结构和更大的催化比表面积。6.将多孔化木瓜蛋白酶CLEAs应用于酶法降解大分子底物壳聚糖制备生物活性低聚糖反应,相同条件下还原糖释放量为游离酶催化时的85%,是传统CLEAs的4倍;采用超滤膜分离技术得到了质量分数为67.5%、相对分子量为5~10kD的具有优良抗菌性能的低聚壳聚糖产品。
中文摘要第3-4页
ABSTRACT第4-5页
前言第11-14页
第一章 文献综述第14-37页
    1.1 交联酶聚体技术研究现状第14-21页
        1.1.1 基本技术及影响因素第14-16页
        1.1.2 新型交联酶聚体研究进展第16-20页
        1.1.3 交联酶聚体在生物催化转化中的应用第20-21页
    1.2 蛋白组学研究概述第21-25页
        1.2.1 蛋白组学研究策略与分析手段第21-23页
        1.2.2 辅助蛋白酶解技术第23-24页
        1.2.3 固定化酶技术在蛋白组学研究中的应用第24-25页
    1.3 酶法合成β-内酰胺类抗生素研究进展第25-28页
        1.3.1 β-内酰胺类抗生素简介第25-27页
        1.3.2 β-内酰胺类抗生素的化学法合成第27页
        1.3.3 β-内酰胺类抗生素的酶法合成第27页
        1.3.4 非传统体系中酶法合成β-内酰胺类抗生素第27-28页
    1.4 酶法降解壳聚糖制备低分子量壳聚糖研究进展第28-33页
        1.4.1 壳聚糖的结构及用途第28-30页
        1.4.2 低聚壳聚糖的性质和生产方法第30-32页
        1.4.3 低聚壳聚糖的生物活性第32-33页
    1.5 本文主要研究内容第33-37页
第二章 胰蛋白酶CLEAs 的制备工艺与催化性质第37-46页
    2.1 引言第37页
    2.2 实验材料和方法第37-39页
        2.2.1 试剂和材料第37-38页
        2.2.2 胰蛋白酶CLEAs 的制备第38页
        2.2.3 胰蛋白酶活性测定第38页
        2.2.4 胰蛋白酶CLEAs 的稳定性第38页
        2.2.5 胰蛋白酶CLEAs 的形貌表征第38-39页
    2.3 结果和讨论第39-44页
        2.3.1 胰蛋白酶CLEAs 制备工艺优化第39-40页
        2.3.2 胰蛋白酶CLEAs 的应用性质第40-41页
        2.3.3 胰蛋白酶CLEAs 的稳定性第41-43页
        2.3.4 胰蛋白酶CLEAs 的微观结构第43-44页
    2.4 本章 小结第44-46页
第三章 胰蛋白酶CLEAs 在蛋白组学分析中的应用第46-60页
    3.1 引言第46-47页
    3.2 实验材料和方法第47-48页
        3.2.1 试剂和材料第47页
        3.2.2 胰蛋白酶CLEAs 的制备第47页
        3.2.3 蛋白溶液酶解第47页
        3.2.4 高温辅助胰蛋白酶CLEAs 酶解第47页
        3.2.5 超声辅助胰蛋白酶CLEAs 酶解第47-48页
        3.2.6 MALDI-TOF 样品制备第48页
        3.2.7 酶解多肽的数据库搜索第48页
    3.3 结果和讨论第48-58页
        3.3.1 游离胰蛋白酶及CLEAs 的自水解第48-49页
        3.3.2 高酶浓度下蛋白酶解第49-50页
        3.3.3 胰蛋白酶CLEAs 高温辅助酶解第50-55页
        3.3.4 胰蛋白酶CLEAs 超声辅助酶解第55-58页
    3.4 本章 小结第58-60页
第四章 糖类添加剂对青霉素酰化酶CLEAs 的活性改善研究第60-71页
    4.1 引言第60-61页
    4.2 实验材料和方法第61-62页
        4.2.1 试剂和材料第61页
        4.2.2 青霉素酰化酶的纯化第61页
        4.2.3 青霉素酰化酶CLEAs 的制备第61页
        4.2.4 青霉素酰化酶水解活性(U_h)的测定第61-62页
        4.2.5 热稳定性第62页
        4.2.6 储存稳定性第62页
    4.3 结果与讨论第62-69页
        4.3.1 青霉素酰化酶的纯化结果第62-64页
        4.3.2 有机沉淀剂对CLEAs 酶活收率的影响第64-66页
        4.3.3 糖类添加剂对CLEAs 酶活改善的作用第66-68页
        4.3.4 糖类添加剂对CLEAs 热稳定性的影响第68-69页
        4.3.5 糖类添加剂对CLEAs 储存稳定性的影响第69页
    4.4 本章 小结第69-71页
第五章 糖类改善青霉素酰化酶CLEAs 活性的表征和机理研究第71-82页
    5.1 引言第71-72页
    5.2 实验材料和方法第72-73页
        5.2.1 试剂和材料第72页
        5.2.2 CLEAs 微观形貌的扫描电子显微镜(SEM)表征第72页
        5.2.3 CLEAs 微环境的激光共聚焦显微镜(CLSM)表征第72页
        5.2.4 青霉素酰化酶二级结构的傅里叶红外光谱(FTIR)表征第72-73页
        5.2.5 催化青霉素水解反应的动力学参数测定第73页
    5.3 结果和讨论第73-80页
        5.3.1 添加海藻糖对CLEAs 微观形貌的影响第73-74页
        5.3.2 添加海藻糖对CLEAs 微环境的影响第74-76页
        5.3.3 添加海藻糖对青霉素酰化酶二级结构的影响第76-78页
        5.3.4 CLEAs 催化青霉素水解反应的动力学参数第78-80页
    5.4 本章 小结第80-82页
第六章 糖类改善青霉素酰化酶CLEAs 在合成阿莫西林中的应用第82-91页
    6.1 引言第82-83页
    6.2 实验材料和方法第83-84页
        6.2.1 试剂和材料第83页
        6.2.2 青霉素酰化酶合成活性(Us)测定第83-84页
        6.2.3 阿莫西林的酶法合成第84页
        6.2.4 阿莫西林合成反应体系各组分含量分析第84页
    6.3 结果和讨论第84-89页
        6.3.1 沉淀剂种类对青霉素酰化酶CLEAs 合成酶活和选择性的影响第84-85页
        6.3.2 糖类添加剂对青霉素酰化酶CLEAs 合成活性和选择性的影响第85-86页
        6.3.3 有机介质体系中酶法合成阿莫西林第86-88页
        6.3.4 底物比例对阿莫西林合成反应的影响第88-89页
    6.4 本章 小结第89-91页
第七章 多孔化木瓜蛋白酶CLEAs 的制备第91-99页
    7.1 引言第91-92页
    7.2 实验材料和方法第92-94页
        7.2.1 试剂和材料第92页
        7.2.2 木瓜蛋白酶CLEAs 及p-CLEAs 的制备第92-93页
        7.2.3 木瓜蛋白酶活性检测第93页
        7.2.4 木瓜蛋白酶催化大分子反应效率的测定第93页
        7.2.5 大分子蛋白底物分子尺寸的测定第93-94页
    7.3 结果和讨论第94-98页
        7.3.1 多孔化木瓜蛋白酶CLEAs 的制备流程第94-95页
        7.3.2 多孔化木瓜蛋白酶CLEAs 的形貌第95页
        7.3.3 多孔化木瓜蛋白酶CLEAs 的催化效率第95-97页
        7.3.4 致孔剂浓度对多孔化木瓜蛋白酶p-CLEAs 催化效率的影响第97-98页
    7.4 本章 小结第98-99页
第八章 多孔化木瓜蛋白酶CLEAs 在水解壳聚糖制备低聚糖中的应用第99-111页
    8.1 引言第99-100页
    8.2 实验材料和方法第100-102页
        8.2.1 试剂和材料第100页
        8.2.2 木瓜蛋白酶p-CLEAs 的制备第100页
        8.2.3 木瓜蛋白酶降解壳聚糖第100页
        8.2.4 木瓜蛋白酶催化降解壳聚糖效率的测定第100-101页
        8.2.5 壳聚糖及其酶解产物的相对分子质量分布第101页
        8.2.6 壳聚糖分子尺寸的测定第101页
        8.2.7 壳聚糖水解产物的超滤膜分离第101页
        8.2.8 壳聚糖水解产物抗菌性测定第101-102页
    8.3 结果和讨论第102-110页
        8.3.1 游离木瓜蛋白酶,CLEAs,p-CLEAs 降解壳聚糖效率对比第102-103页
        8.3.2 木瓜蛋白酶p-CLEAs 降解不同分子量壳聚糖底物对比第103-104页
        8.3.3 木瓜蛋白酶p-CLEAs 水解壳聚糖过程分子量及多分散度变化第104-108页
        8.3.4 木瓜蛋白酶p-CLEAs 降解壳聚糖的重复利用性第108-109页
        8.3.5 壳聚糖水解产物的抗菌性能第109-110页
    8.4 本章 小结第110-111页
第九章 结论与展望第111-116页
    9.1 结论第111-113页
        9.1.1 CLEAs 的制备工艺及技术改进第111-112页
        9.1.2 CLEAs 及改进技术在蛋白组学与生物催化中的应用第112-113页
    9.2 本文主要创新点第113页
    9.3 展望第113-116页
参考文献第116-135页
发表论文和参加科研情况说明第135-137页
附录一: HPLC 测定阿莫西林合成体系中各组分色谱保留时间及浓度标准曲线第137-138页
附录二: 壳聚糖降解产物还原糖含量标准曲线第138页
附录三: PEG/PEO 标准品的凝胶排阻色谱曲线第138-139页
致谢第139页
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