重组人前蛋白转化酶枯草溶菌素9纳米抗体制备

人前蛋白转化酶枯草溶菌素9论文 抗体组库论文 重链抗体论文
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骆驼科动物除了拥有传统重链和轻链组成的异源双链抗体外,还拥有一种天然缺失轻链,只由同源重链二聚体形成的重链抗体(Heavy-chain antibodies,HCAbs),克隆其可变区得到的单域抗体是最小的功能性抗原结合片段,称为重链抗体重链可变区(Variable domain of heavy chain of heavy-chain antibodies,VHHs),由于其大小只有传统抗体的1/10,亦称纳米抗体(Nanobody)。相对于传统抗体,纳米抗体具有相对分子质量小、可溶性高、稳定性强、易表达生产等特点。前蛋白转化酶枯草溶菌素9(Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9,PCSK9)是由692个氨基酸组成的分泌型丝氨酸蛋白酶,它能介导低密度脂蛋白受体降解,导致血浆低密度脂蛋白胆固醇水平升高,增加患心血管疾病的风险。PCSK9单克隆抗体药物是最新上市的高特异性降脂药,但是其价格昂贵,目前只用于遗传性高胆固醇血症的治疗。本研究旨在研发PCSK9特异性纳米抗体,采用人胚肾细胞(Human embryo kidney 293F,HEK293F)表达纯化PCSK9蛋白,免疫双峰骆驼,通过高通量测序技术和蛋白质组学技术,筛选出特异性PCSK9纳米抗体。主要内容如下:1、成功构建了包含PCSK9基因的pYD7重组蛋白表达质粒,实现了PCSK9蛋白在HEK293F细胞的分泌表达。所表达的蛋白分子量约为60kDa,与人天然的PCSK9蛋白分子量相同,且纯度可以达到87.38%,平均表达量达到4 mg/L以上。2、通过酶联免疫吸附反应(Enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)测定特异性抗PCSK9的重链抗体的免疫应答曲线,发现经过三次免疫之后,抗体效价达到1:256000。同时,采集PCSK9蛋白免疫后的双峰骆驼血清,串联使用Protein G和Protein A纯化柱提取血清中的重链抗体,再经偶联PCSK9的磁珠进一步纯化,获得特异性抗PCSK9重链抗体,为蛋白组学技术分析重链抗体氨基酸序列提供样品。3、通过分离骆驼外周血单核细胞,提取mRNA,利用多重PCR和Illumina Mi-seq高通量测序技术对三头双峰骆驼的重链抗体可变区进行深度测序,分析了重链抗体组库V、J基因组成、重排时末端基因删除数和V-J基因配对率,以及CDR3的长度、香农多样性指数(Shannon index)、氨基酸组成分布等基本特征。鉴定出平均每头胳驼130000条有效数据和67561条独特CDR3序列,重链抗体含量较高的V基因为IGHV1S45、IGHV1S50和IGHV1S52,J基因为IGHJ4和IGHJ6,所对应的V-J基因配对含量大于40%。这些骆驼重链抗体组库的基本特征分析为进一步制定筛选高特异性纳米抗体的算法奠定了基础。本研究成功建立了在HEK293F细胞快速制备毫克级PCSK9蛋白的方法,免疫骆驼后,测定了多克隆抗体血清中特异性抗PCSK9重链抗体的效价,制备纯化了特异性抗PCSK9重链抗体,同时,分析了双峰骆驼重链抗体组库的基本特征,为后续采用高通量测序和蛋白质组学技术筛选鉴定高特异性和高亲和力PCSK9纳米抗体奠定基础。
摘要第5-7页
Abstract第7-8页
缩略词表第12-13页
第一章 绪论第13-25页
    1.1 抗体组库的概述第13-16页
        1.1.1 抗体组库具有多样性第13-14页
        1.1.2 高通量测序技术研究抗体组库第14-16页
    1.2 重链抗体的研究现状第16-19页
        1.2.1 重链抗体的发现与结构特征第16-17页
        1.2.2 纳米抗体的基因分类第17页
        1.2.3 纳米抗体的特点第17-18页
        1.2.4 获取纳米抗体的途径第18-19页
    1.3 PCSK9的研究现状第19-22页
        1.3.1 PCSK9的发现与结构第19-20页
        1.3.2 PCSK9与心血管疾病第20-21页
        1.3.3 降脂药物的研究现状第21-22页
    1.4 研究目的和内容第22-24页
    1.5 技术路线第24-25页
第二章 PCSK9重组蛋白的表达与鉴定第25-40页
    2.1 引言第25页
    2.2 实验材料第25-30页
        2.2.1 细胞株及载体第25-26页
        2.2.2 实验试剂、材料第26-27页
        2.2.3 实验仪器第27-28页
        2.2.4 配制溶液第28-30页
    2.3 实验方法第30-36页
        2.3.1 构建表达载体第30页
        2.3.2 pYD7重组质粒的大量制备第30-31页
        2.3.3 pYD7质粒酶切验证第31-32页
        2.3.4 悬浮HEK293F细胞表达PCSK9重组蛋白第32-33页
        2.3.5 重组蛋白的纯化与鉴定第33-36页
    2.4 实验结果与讨论第36-39页
        2.4.1 pYD7质粒酶切验证第36页
        2.4.2 HEK293F悬浮细胞表达PCSK9重组蛋白的纯化与鉴定第36-38页
        2.4.3 PCSK9重组蛋白活性检测第38-39页
    2.5 本章小结第39-40页
第三章 PCSK9重链抗体的提取与鉴定第40-51页
    3.1 引言第40页
    3.2 实验材料第40-43页
        3.2.1 双峰骆驼第40页
        3.2.2 实验材料第40-41页
        3.2.3 实验仪器第41-42页
        3.2.4 配制溶液第42-43页
    3.3 实验方法第43-46页
        3.3.1 PCSK9重组蛋白免疫双峰骆驼及多克隆血清收集第43页
        3.3.2 提取骆驼血清中的重链抗体第43-45页
        3.3.3 ELISA检测PCSK9特异性重链抗体的免疫应答曲线第45-46页
        3.3.4 在细胞水平鉴定骆驼多克隆抗体血清的活性第46页
    3.4 结果与讨论第46-50页
        3.4.1 提取骆驼血清中的PCSK9特异性重链抗体第46-47页
        3.4.2 ELISA检测PCSK9特异性重链抗体的免疫应答曲线第47-49页
        3.4.3 在细胞水平鉴定骆驼多克隆抗体血清的活性第49-50页
    3.5 本章小结第50-51页
第四章 双峰骆驼重链抗体组库的基本特征研究第51-61页
    4.1 引言第51页
    4.2 实验材料第51-52页
        4.2.1 双峰骆驼第51-52页
        4.2.2 实验试剂和材料第52页
        4.2.3 实验仪器第52页
    4.3 实验方法第52-53页
        4.3.1 分离外周血单核细胞和提取mRNA第52-53页
        4.3.2 构建免疫文库第53页
        4.3.3 测序和数据分析第53页
    4.4 实验结果与讨论第53-60页
        4.4.1 测序数据概览第53-55页
        4.4.2 V、J基因的使用第55-56页
        4.4.3 V-J配对的含量第56页
        4.4.4 CDR3特征综合分析第56-58页
        4.4.5 纳米抗体基因重排特征分析第58页
        4.4.6 讨论第58-60页
    4.5 本章小结第60-61页
结论与展望第61-63页
    结论第61页
    创新之处第61页
    展望第61-63页
参考文献第63-71页
攻读硕士学位期间取得的研究成果第71-72页
致谢第72-73页
附表第73页
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