超级杂交稻两优培九EREBP cDNA的生物信息学分析与克隆

超级杂交稻是在我国种植面积极广的一种粮食作物，目前我国的超级杂交稻在超高产育种领域已取得了令世界瞩目的成就。乙烯反应元件结合蛋白与植物生长发育、抗病和抗逆性等一些重要生理生化反应的基因调控有着密切的关系，近年来已成为研究的热点，并取得了一定进展。生物信息学结合分子生物学、遗传学等生物技术手段，为研究乙烯反应元件结合蛋白提供了帮助。本研究以生物信息学的分析为基础，利用模式植物拟南芥中编码乙烯反应元件结合蛋白的cDNA，对现有的水稻基因组数据库进行搜索，获得一条高同源的未知序列。通过对这条未知序列的核酸序列和蛋白质序列、结构、性质、功能等方面的一系列生物信息学分析，表明未知序列应为水稻中编码乙烯反应元件结合蛋白的cDNA。以超级杂交稻为材料，提取总RNA并反转录成cDNA，用未知序列设计一对简并引物，经PCR扩增出编码乙烯反应元件结合蛋白的cDNA片段，cDNA片段经T-A克隆后进行测序，获得一条长915bp的cDNA片段，BLAST表明未知序列的部分核酸序列与AK119885的同源性达到了99％。提交NCBI的GenBank后接收，登录号为EF507537。