文蛤弧菌病的病原分析、免疫应答及抗性选育研究

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文蛤(Meretrix meretrix)是我国沿海重要的经济贝类,是我国沿海开发滩涂、发展贝类养殖的理想对象,具有广阔的市场前景和较高的经济价值。与其他养殖贝类一样,文蛤养殖产业也正在面临着病害带来的负面影响,造成了较为严重的经济损失。开展贝类抗性品种的培育,是应对养殖病害、实现健康养殖的重要途径。从病原致病机理和宿主免疫防御机制等方面开展系统研究,能够为贝类抗性选育提供理论基础和科学方法。本研究通过对从2007年江苏沿海文蛤病害中所取文蛤样品的细菌分离、鉴定以及致病力分析发现,菌株MM21(副溶血弧菌)及MM5(类弗尼斯弧菌)能够引起文蛤较高的致死率,通过观察感染文蛤各组织的组织病理学变化以及细胞病理学变化发现,菌株MM21和MM5能够引起文蛤肝胰腺、鳃、外套膜等组织的病理学损伤,如脂滴增多、代谢紊乱、分泌加剧、颗粒沉积以及感染弧菌的入侵等。致病性以及致病机理的研究证明,弧菌属细菌是文蛤的重要致病菌,尤其是副溶血弧菌能够引起文蛤的高致死率。从宿主免疫角度出发,分别分析了弧菌感染后文蛤中免疫直接效应因子i型溶菌酶以及免疫间接效应因子热休克蛋白70的免疫应答变化。结果显示,弧菌刺激后文蛤肝胰腺和鳃中i型溶菌酶的mRNA表达量以及蛋白表达量都显著上升,另外文蛤i型溶菌酶重组蛋白对弧菌具有抗菌活性,进一步证明i型溶菌酶在文蛤抗弧菌免疫中发挥作用;同样地,弧菌刺激后文蛤肝胰腺和鳃中热休克蛋白70的mRNA表达量以及蛋白表达量也显著上升,说明热休克蛋白参与文蛤抗弧菌免疫。因此,i型溶菌酶以及热休克蛋白70能够作为反映文蛤健康状况的参数并作为候选分子标记应用于弧菌抗性文蛤品系的选育。选择抗弧菌作为育种目标,采用攻毒实验结合群体内选育的方法进行了抗性文蛤品系的选择育种,获得了抗性文蛤的亲本群体并繁育了抗性文蛤的F1子代。以致死率为表型指标的评估显示,抗性文蛤F1子代的弧菌致死率显著低于对照群体,说明抗性文蛤F1子代获得了对弧菌增加的抗性。利用已获得的弧菌抗性文蛤遗传材料对i型溶菌酶基因中存在的单核苷酸多态性(SNP)进行了研究,对不同SNP与抗性的相关性分析发现,在所检测的i型溶菌酶SNP中,10个SNP位点与文蛤抗性呈显著相关,不同基因型的文蛤平均体重存在显著差异,抗性群体相较对照群体具有独特的优势单倍型。另外这10个SNP位点与文蛤体重具有相关性。以上分析说明,i型溶菌酶中的SNP标记与文蛤抗弧菌性状相关,能够作为文蛤抗弧菌的潜在分子标记应用于弧菌抗性文蛤的选育。
摘要第4-6页
Abstract第6-7页
第一章 文献综述第13-37页
    1.1 引言第13-14页
    1.2 养殖贝类主要疾病——弧菌病第14-20页
        1.2.1 贝类弧菌病的文献报道第14-15页
        1.2.2 弧菌的种类与鉴定手段第15-19页
            1.2.2.1 弧菌的生化鉴定第15-17页
            1.2.2.2 弧菌的分子鉴定第17-19页
        1.2.3 弧菌的流行病学与致病机理第19-20页
    1.3. 贝类的免疫应答第20-28页
        1.3.1 直接效应免疫相关基因——溶菌酶第21-24页
            1.3.1.1 溶菌酶的种类与功能第22页
            1.3.1.2 i 型溶菌酶第22-24页
        1.3.2 间接效应免疫相关基因——热休克蛋白第24-28页
            1.3.2.1 热休克蛋白的种类与功能第24-26页
            1.3.2.2 热休克蛋白70第26-28页
    1.4 贝类的抗性选育第28-34页
        1.4.1 贝类抗性选育的原理第28-30页
            1.4.1.1 数量遗传学的兴起第28-29页
            1.4.1.2 贝类抗性选育的可行性第29页
            1.4.1.3 贝类抗病指标的选择第29-30页
        1.4.2 贝类抗性选育的方法第30-34页
            1.4.2.1 表型选择与基因型选择第30-33页
            1.4.2.2 品系选育与家系选育第33-34页
    1.5 研究的目的和意义第34-37页
第二章 文蛤致病菌的分离、鉴定与致病机理分析第37-65页
    2.1 引言第37-38页
    2.2 文蛤致病菌副溶血弧菌的分离、鉴定、致病力与致病机理分析第38-51页
        2.2.1 材料与方法第38-41页
            2.2.1.1 患病文蛤体内细菌的分离与形态学分析第38页
            2.2.1.2 细菌的分子鉴定第38-39页
            2.2.1.3 细菌的生化鉴定与抗生素敏感检测第39页
            2.2.1.4 细菌致病力的初步筛查分析第39-40页
            2.2.1.5 毒力最强菌株的定量毒力检验第40-41页
            2.2.1.6 感染文蛤的细胞病理学观察第41页
            2.2.1.7 毒力基因toxR,tlh,tdh 的检测第41页
            2.2.1.8 统计分析第41页
        2.2.2 结果第41-48页
            2.2.2.1 细菌的分离及其毒力初步筛查分析第41-42页
            2.2.2.2 菌株MM21 的鉴定第42-45页
            2.2.2.3 菌株MM21 的定量毒力分析第45-46页
            2.2.2.4 感染MM21 后文蛤的细胞病理学变化第46-48页
        2.2.3 讨论第48-51页
    2.3 文蛤致病菌类弗尼斯弧菌的分离、鉴定、致病力与致病机理分析第51-65页
        2.3.1 材料与方法第51-53页
            2.3.1.1 患病文蛤体内细菌的分离与致病力分析第51页
            2.3.1.2 细菌的分子鉴定第51-52页
            2.3.1.3 细菌的生化鉴定第52页
            2.3.1.4 细菌的毒力检测第52-53页
            2.3.1.5 感染文蛤的细胞病理学观察第53页
            2.3.1.6 感染文蛤的组织病理学观察第53页
            2.3.1.7 统计分析第53页
        2.3.2 结果第53-62页
            2.3.2.1 菌株MM5 的形态特征第53-54页
            2.3.2.2 MM5 的分子鉴定结果第54-55页
            2.3.2.3 MM5 的生化鉴定结果第55-57页
            2.3.2.4 MM5 的毒力测试第57页
            2.3.2.5 感染MM5 文蛤的细胞病理学变化第57-59页
            2.3.2.6 MM5 引起的组织病理学变化第59-62页
        2.3.3 讨论第62-65页
第三章 文蛤免疫相关基因的克隆及其在宿主免疫应答中的功能分析第65-103页
    3.1 引言第65-66页
    3.2 文蛤溶菌酶基因的克隆与功能分析第66-83页
        3.2.1 材料与方法第66-73页
            3.2.1.1 感染实验与样品采集第66页
            3.2.1.2 文蛤溶菌酶cDNA 全长的克隆第66-67页
            3.2.1.3 序列特性分析第67-69页
            3.2.1.4 文蛤溶菌酶的原核重组表达第69-70页
            3.2.1.5 重组蛋白的质谱鉴定第70页
            3.2.1.6 重组蛋白的溶菌酶活性分析第70-71页
            3.2.1.7 重组蛋白的抗菌活性分析第71-72页
            3.2.1.8 文蛤溶菌酶转录本的半定量检测第72页
            3.2.1.9 文蛤溶菌酶多克隆抗体的制备第72-73页
            3.2.1.10 文蛤溶菌酶蛋白的半定量检测第73页
            3.2.1.11 统计分析第73页
        3.2.2 结果第73-82页
            3.2.2.1 文蛤溶菌酶的序列分析第73-76页
            3.2.2.2 文蛤溶菌酶重组蛋白的获得和鉴定第76-78页
            3.2.2.3 文蛤溶菌酶重组蛋白的活性分析第78-80页
            3.2.2.4 文蛤溶菌酶的组织分布第80页
            3.2.2.5 弧菌感染引起的文蛤溶菌酶的表达变化第80-82页
        3.2.3 讨论第82-83页
    3.3 文蛤热休克蛋白70 的克隆与功能分析第83-103页
        3.3.1 材料与方法第83-90页
            3.3.1.1 感染实验与样品采集第83-84页
            3.3.1.2 文蛤热休克蛋白70 cDNA 全长的克隆第84-85页
            3.3.1.3 序列特性分析第85-87页
            3.3.1.4 文蛤热休克蛋白70 转录本的定量检测第87-88页
            3.3.1.5 文蛤热休克蛋白70 蛋白的定量检测第88-89页
            3.3.1.6 统计分析第89-90页
        3.3.2 结果第90-99页
            3.3.2.1 文蛤热休克蛋白70 的序列分析第90-93页
            3.3.2.2 弧菌感染引起的文蛤热休克蛋白70 mRNA 的空间表达变化第93-95页
            3.3.2.3 弧菌感染引起的文蛤热休克蛋白70 mRNA 的时间表达变化第95-96页
            3.3.2.4 弧菌感染引起的文蛤热休克蛋白70 蛋白的空间表达变化第96-99页
        3.3.3 讨论第99-103页
第四章 弧菌抗性文蛤群体的选育及溶菌酶SNP 在选育群体中的分析第103-123页
    4.1 引言第103-104页
    4.2 弧菌抗性文蛤群体的培育第104-109页
        4.2.1 材料与方法第104-107页
            4.2.1.1 文蛤亲本的弧菌感染实验第104页
            4.2.1.2 文蛤的催产与受精第104-105页
            4.2.1.3 文蛤幼虫与稚贝的培育第105页
            4.2.1.4 文蛤F1 子代的弧菌感染实验第105-106页
            4.2.1.5 统计分析第106-107页
        4.2.2 结果第107-108页
            4.2.2.1 弧菌抗性文蛤亲本(09-P)及其F1 子代(09RP)的获得第107-108页
            4.2.2.2 09RP 的弧菌抗性确认第108页
        4.2.3 讨论第108-109页
    4.3 文蛤溶菌酶SNP 与弧菌抗性及生长的相关性分析第109-123页
        4.3.1 材料与方法第109-112页
            4.3.1.1 检测所用文蛤群体第109页
            4.3.1.2 DNA 提取与体重测量第109-110页
            4.3.1.3 溶菌酶gDNA 片段的PCR 扩增与测序第110-111页
            4.3.1.4 SNP 检测与分型第111页
            4.3.1.5 数据分析第111-112页
        4.3.2 结果第112-120页
            4.3.2.1 检测到的溶菌酶SNP第112页
            4.3.2.2 溶菌酶SNP 与弧菌抗性的相关性分析第112-116页
            4.3.2.3 溶菌酶SNP 与生长的相关性分析第116-120页
        4.3.3 讨论第120-123页
结论第123-125页
参考文献第125-140页
博士期间发表的文章及申请的专利第140-141页
致谢第141-142页
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论文编号ABS538854,这篇论文共142页
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