CRISPR-Cas9系统对大肠杆菌基因组的编辑和细菌耐药性逆转方面的研究

基因编辑论文 CRISPR-Cas9系统论文
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摘要第4-6页
Abstract第6-7页
第一章 绪论第15-27页
    1.1 基因编辑与CRISPR-Cas9系统第15-20页
        1.1.1 传统基因编辑技术第15-16页
        1.1.2 CRISPR-Cas9系统介绍第16-18页
        1.1.3 CRISPR系统的应用第18-20页
    1.2 抗生素杀菌与细菌耐药性的产生第20-25页
        1.2.1 传统抗生素的分类与作用机制第20-21页
        1.2.2 细菌耐药性的产生第21-23页
        1.2.3 针对耐药菌的传统疗法和新型疗法第23-25页
            1.2.3.1 传统治疗方法----抗生素治疗第23-24页
            1.2.3.2 噬菌体及噬菌体裂解酶疗法第24页
            1.2.3.3 金属螯合剂第24-25页
            1.2.3.4 光动力疗法第25页
    1.3 研究依据与目的第25-27页
第二章 材料与方法第27-37页
    2.1 实验设备与主要试剂及配制第27-30页
        2.1.1 实验仪器设备第27-28页
        2.1.2 实验试剂第28-29页
        2.1.3 主要试剂溶液配制第29-30页
    2.2 实验方法第30-37页
第三章 CRISPR-Cas9系统对E.coli基因组的编辑第37-44页
    3.1 前言第37页
    3.2 利用CRISPR-Cas9进行ftnA单基因敲除第37-39页
    3.3 利用CRISPR-Cas9进行ftnAftnB双基因敲除第39-41页
    3.4 利用CRISPR-Cas9进行kdpD点突变第41-44页
第四章 CRISPR-Cas9系统对细菌耐药性的逆转第44-59页
    4.1 前言第44-45页
    4.2 相关耐药质粒,菌株构建第45-46页
        4.2.1 KPC,NDM,OXA耐药质粒的构建第45页
        4.2.2 针对耐药质粒的CRISPR-Cas9相关质粒的构建第45-46页
    4.3 针对碳青霉烯类抗生素耐药性的逆转第46-56页
        4.3.1 MIC测定第46-47页
        4.3.2 CRISPR系统对耐药质粒传播的影响第47-48页
        4.3.3 非诱导条件下CRISPR系统对耐药质粒的消除情况第48-52页
            4.3.3.1 针对耐药基因进行单位点切割第48-50页
            4.3.3.2 针对耐药基因进行双位点切割第50-52页
        4.3.4 IPTG诱导情况下CRISPR系统对耐药质粒的消除情况第52-56页
            4.3.4.1 IPTG诱导sgRNA表达对WT中耐药质粒消除效率的影响第52-53页
            4.3.4.2 IPTG诱导sgRNA表达对同源修复缺陷型菌株中耐药质粒消除效率的影响第53-56页
    4.4 针对多粘菌素类耐药性的逆转第56-59页
        4.4.1 多粘菌素类耐药菌MIC的测定及针对耐药基因的CRISPR-Cas9相关质粒的构建第56-57页
        4.4.2 非诱导情况下CRISPR系统对耐药质粒的消除情况第57-58页
        4.4.3 IPTG诱导情况下CRISPR系统对耐药质粒的消除情况第58-59页
第五章 Cloning-free CRISPR第59-61页
    5.1 前言第59页
    5.2 Cloning-free CRISPR系统质粒构建及对耐药质粒消除第59-61页
第六章 讨论与展望第61-66页
参考文献第66-71页
附录第71-82页
致谢第82-83页
攻读硕士期间发表论文第83页
录用证明第83页
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