酿酒酵母Sfil功能性多肽的体外表达与分析

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Sfi1蛋白是与酿酒酵母细胞周期密切相关的一种蛋白,其主要功能是维持细胞分裂过程中纺锤体的正确装配,在细胞分裂、细胞形态维持等方面具有重要的作用,但是迄今鲜有文献从分子水平对Sfi1蛋白结构与功能进行系统研究。Sfilp具有21个LLX3F/LX2W模式的内部重复序列,以及20个间隔序列,位于该蛋白的中央区域。Sfilp中央区域的功能主要在于,通过内部重复序列结合酵母中心体蛋白Cdc31p,从而作用于SPB的复制过程。然而,Sfilp的氨基端与羧基端区域虽不含有内部重复序列,但是生物信息学分析发现,Sfilp的羧基端存在七个,氨基端存在两个可能的细胞周期蛋白依赖激酶Cdc28的保守磷酸化位点;同时酵母细胞水平发现,将其缺失会导致细胞分裂出现异常,在调控SPB的复制功能上起关键性作用。因此对Sfi1蛋白的深入研究,本课题重点是从其功能性多肽的研究角度来切入,其中包括对内部保守多肽和两端的磷酸化多肽的分析。本论文从两个方面来阐述对酿酒酵母Sfilp功能性多肽的研究,一方面通过对其内部21个保守多肽的同源分析,发现第20个保守多肽具有研究代表性,我们针对此段多肽构建肽库,其中包括野生型,定点突变型以及随机突变型Sfi1多肽,来研究突变对Sfi1多肽与中心体蛋白Cdc31p相互作用的影响,以及对Sfilp生物学功能的影响;一方面针对Sfilp氨基端和羧基端的磷酸化多肽进行体外表达,为后期的体外磷酸化研究奠定基础。本实验通过计算机同源模建来比对位于第20个保守多肽上的定点突变型Sfi1多肽,即Sfi1p-763的三维构象,将此位置的氨基酸进行随机突变,发现L763H的末端构象稍有差异,a-螺旋较为舒展,然后利用常规PCR技术及融合PCR技术,分别扩增得到SFIl野生型及定点突变型的基因序列,再利用酵母表面展示技术,在酵母细胞中诱导表达Sfi1多肽,发现其诱导表达的最佳条件为诱导温度20℃,乳糖浓度0.02g/ml,诱导时间24h。通过SDS-PAGE检测,发现Sfi1p定点突变L763H并没有影响Sfi1多肽与Cdc31p的相互作用。而通过流式细胞检测DNA含量发现,L763H使细胞周期停滞在G2/M期,并且影响酵母细胞的生长状态。本实验还采用错误倾向PCR技术,扩增得到Sfi1多肽的编码基因库;将编码基因克隆至表面展示载体,获得Sfi1多肽表达载体库;将表达载体库转化酵母细胞,诱导表达多肽,获得Sfi1多肽肽库,并通过SDS-PAGE检测Sfi1随机突变多肽与Cdc31p的相互作用。此外,通过常规PCR技术扩增得到sFIl-N端和C端基因序列,构建至蛋白表达载体pET上,在大肠杆菌BL21细胞中,使用诱导剂IPTG对Sfilp-N端和C端多肽进行体外诱导表达,其中Sfilp-N端多肽诱导表达的最佳条件是:诱导温度为25℃,IPTG终浓度为1.0mmol/L,诱导时间为4h:Sfilp-C端多肽诱导表达的最佳条件是诱导温度为30℃,IPTG终浓度为1.0mmol/L,诱导时间为8h.Sfilp-N端和C端磷酸化多肽成功地体外表达,为研究Sfilp-N端和C端的磷酸化机制奠定了基础。
摘要第4-6页
Abstract第6-7页
表格目录第12-13页
图片目录第13-14页
第一章 前言第14-28页
    1 酿酒酵母的研究优势第14-16页
        1.1 酿酒酵母是一种重要的真核模式生物第14-15页
        1.2 以酿酒酵母作为模式生物的研究意义第15-16页
    2 酿酒酵母的纺锤体极体第16-21页
        2.1 SPB的结构第16-17页
        2.2 SPB的复制与细胞周期第17-19页
        2.3 SPB的关键蛋白组分第19-20页
        2.4 影响SPB功能的重要调控蛋白第20-21页
    3 酿酒酵母纺锤体极体蛋白组分Sfi1p第21-23页
    4 酿酒酵母Sfi1p的研究进展第23-25页
    5 本课题的研究思路第25-28页
第二章 材料与方法第28-48页
    1 实验材料第28-36页
        1.1 质粒,菌株与引物第28-30页
        1.2 主要实验仪器第30-31页
        1.3 药品与试剂第31-34页
            1.3.1 主要药品第31-32页
            1.3.2 主要试剂第32-34页
        1.4 培养基第34-36页
    2 实验方法第36-48页
        2.1 菌种的培养与保存第36-38页
            2.2 大肠杆菌感受态细胞Top10的制备与转化第36-38页
        2.3 CTAB法提取质粒DNA第38-39页
        2.4 DNA的限制性内切酶消化第39页
        2.5 DNA的纯化第39-40页
        2.6 酚抽提纯化DNA第40-41页
        2.7 线性DNA的去磷酸化第41页
        2.8 DNA的连接反应第41-42页
        2.9 琼脂糖凝胶电泳验证方法第42页
        2.10 常规PCR扩增技术第42-43页
        2.11 融合PCR技术第43-44页
        2.12 错误倾向PCR技术第44页
        2.13 酵母细胞的快速转化法第44-45页
        2.14 PCR法验证酵母交配型第45页
        2.15 HO质粒法构建二倍体细胞第45页
        2.16 酵母高效产孢法第45-46页
        2.17 聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)验证方法第46-48页
第三章 酿酒酵母Sfi1保守多肽肽库的构建与分析第48-73页
    1 实验材料与方法第50-59页
        1.1 Sfi1保守多肽的同源分析第50-51页
            1.1.1 Sfi1保守多肽中关键氨基酸的特点分析第50页
            1.1.2 Sfi1保守多肽的二级结构分析第50-51页
        1.2 Sfi1p 20~(th)保守多肽中特定氨基酸突变的结构与功能分析第51-56页
            1.2.1 Sfi1p-L763随机突变的同源模拟第51-52页
            1.2.2 SFI1-W763和SFI1-M763基因序列的扩增第52-53页
            1.2.3 重组质粒pYD1-W763和pYD1-M763的构建及其鉴定第53-54页
            1.2.4 Sfi1多肽在酵母中的诱导表达与检测第54-55页
            1.2.5 Sfi1p与Cde31p的相互作用与检测第55页
            1.2.6 Sfi1p的流式细胞周期及DNA含量的检测第55页
            1.2.7 Sfi1p突变对酵母细胞生长的影响第55-56页
        1.3 酿酒酵母Sfi120~(th)保守多肽中随机氨基酸突变的肤库的建立第56-59页
            1.3.1 多肽编码基因库的建立第56-57页
            1.3.2 多肽表达载体库pYD1-S20的构建第57-58页
            1.3.3 多肽表达菌株库的构建第58页
            1.3.4 Sifl多肽肽库的构建第58页
            1.3.5 Sfil随机突变多肽与Cdc31p的相互作用与检测第58-59页
    2 实验结果第59-70页
        2.1 Sfi1保守多肽的同源分析第59-60页
            2.1.1 Sfi1保守多肽中关键氨基酸的特点分析第59页
            2.1.2 Sfi1保守多肽的二级结构分析第59页
            2.1.3 Sfi1第20个保守多肽的特点第59-60页
        2.2 Sfi1p 20~(th)保守多肽中特定氨基酸突变的结构与功能分析第60-67页
            2.2.1 Sfi1p-L763氨基酸随机突变的三维结构的拟合第60页
            2.2.2 SFI1-W763和SFI1-M763基因序列的扩增结果验证第60页
            2.2.3 重组载体pYD1-W763和pYD1-M763的酶切验证第60-61页
            2.2.4 SFI1-W763和SFI1-M763基因序列和相应的氨基酸序列比对第61-62页
            2.2.5 中心体蛋白Cdc31p诱导表达的SDS-PAGE验证第62-63页
            2.2.6 野生型Sfi1多肽体外表达的SDS-PAGE检测第63-64页
            2.2.7 突变型Sfi1多肽体外表达的SDS-PAGE检测第64-65页
            2.2.8 Sfi1多肽与Cdc31p相互作用结果检测第65-66页
            2.2.9 野生型Sfi1多肽和突变型Sfi1多肽的流式细胞周期检测第66-67页
            2.2.10 Sfi1p突变对酵母细胞有丝分裂的影响第67页
        2.3 酿酒酵母Sfi120~(th)保守多肽中随机氨基酸突变的肽库的建立第67-70页
            2.3.1 错误倾向PCR产物的琼脂糖凝胶电泳验证第67-68页
            2.3.2 重组载体pYD1-S20的酶切验证第68页
            2.3.3 Sfi1随机突变多肽与Cdc31p相互作用结果检测第68-70页
    3 讨论第70-73页
第四章 酿酒酵母Sfi1p磷酸化多肽的体外表达与分析第73-84页
    1 实验材料与方法第73-75页
        1.1 SFI1氨基端和羧基端基因序列的扩增第73-74页
        1.2 重组质粒pET-SN和pET-SC的构建与鉴定第74页
        1.3 Sfi1p磷酸化多肽在大肠杆菌中的诱导表达第74-75页
    2 实验结果第75-82页
        2.1 重组载体pET-SN和pET-SC的构建示意图第75页
        2.2 SFI1氨基端和羧基端基因序列的扩增验证第75-76页
        2.3 重组载体pET-SN和pET-SC的酶切验证第76-77页
        2.4 SFI1-N端和SFI1-C端基因的测序比对第77-79页
        2.5 Sfi1p-N端和Sfi1p-C端编码氨基酸的序列比对第79-80页
        2.6 Sfi1磷酸化多肽体外诱导表达条件的优化第80-82页
    3 讨论第82-84页
结论与展望第84-85页
参考文献第85-90页
个人简历第90页
获得学士、硕士学位的学校、时间第90页
在学期间发表的学术论文与研究成果第90-91页
致谢第91页
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