北海红树林根系土壤中细菌多样性的T-RFLP分析及放线菌的分离与鉴定

红树林生长在热带、亚热带的海湾河口地区潮间带，受周期性潮水浸淹，是生物多样性高度浓缩的海岸带生态关键区。本研究从两个方面对北海红树林根系土壤中微生物多样性进行了分析。其一是对不同深度的土壤样品进行了硫化物、粒度、碳氮磷含量和盐度、pH值的测定，并提取土壤样品中的总DNA进行细菌多样性的T-RFLP分析。研究表明所有样品中砂、细砂和极细砂比例均达到70%以上，21-25cm深度土壤中的pH值、盐度、硫化物、总有机质和全氮是最低的；在0-5cm深度样品发现有121OTU，6-10cm深度样品发现有106OTU，11-15cm深度样品发现有53OTU，16-20cm深度样品发现有128OTU，21-25cm深度样品发现有148OTU，26-30cm深度样品发现有151OTU，荧光强度超过30000有24OTU，31-35cm深度样品发现有172OTU，36-40cm深度样品发现有133OTU，41-45cm深度样品发现有190OTU，46-50cm深度样品发现有50OTU，这表明0-50cm深度的土壤中蕴含着丰富的细菌多样性资源。其二是应用DDC预处理技术对9份红树林根系土壤样品进行处理，并结合16种不同的分离培养基对放线菌做选择性分离，用微波法快速提取了放线菌基因组DNA，并做了16S rDNA序列分析，共得到72株放线菌，分别属于微杆菌属、棍状杆菌属、短小杆菌属、纤维微菌属、放线菌属，其中稀有放线菌占91%。为红树林根系土壤微生物资源的研究提供了实验依据。