半滑舌鳎IGF1和IGF2基因SNP与mRNA表达和生长性状的相关性研究

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本文以人工养殖的半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)为实验对象,对半滑舌鳎IGF1和IGF2基因的多态性进行检测,并分析其与激素、生长性状、血液生理生化指标、基因表达的相关性。结果如下:1.雄性半滑舌鳎IGF1基因的SNP与mRNA表达和生长性状的相关性分析胰岛素样生长因子1(IGF1)在鱼类生长内分泌调节过程中发挥着重要的调控作用。本文探究了雄性半滑舌鳎IGF1基因外显子的单核苷酸多态性,并分析了其基因型与生长性状、血液生化指标及mRNA表达的相关性。结果显示,IGF1基因外显子5的884bp处一个位点发生突变,即C884A,此突变发生于终止密码子之后,并且发生在WD40结构域,可能对基因的转录、表达和生长性状产生影响。此位点与体重(P<0.05)和去内脏重(P<0.05)呈显著相关性,AA基因型的体重和去内脏重显著高于AB基因型(P<0.05),AA基因型的尿素含量显著大于AB基因型(P<0.05),AA基因型mRNA表达量也显著高于AB基因型(P<0.01)。研究表明,IGF1基因编码区的多态性对半滑舌鳎生长性状、血液生化指标和基因表达有显著影响,可以作为选择育种的一种分子标记,从遗传学的角度辅助半滑舌鳎优良品种的分子选育,提高半滑舌鳎优良品种的产量。2.雌性半滑舌鳎IGFl基因SNP与mRNA表达和生长性状的相关性分析本研究中,运用SSCP和DNA测序方法检测了雌性半滑舌鳎IGF1基因外显子的单核苷酸多态性(SNPs),并分析其基因型与生长性状及基因表达的相关性。结果显示,雌性IGF1基因突变位点与雄性一致,也是外显子5的884bp处,即C884A,此突变发生于终止密码子之后,并且发生在WD40结构域,可能对基因的转录、表达和生长性状产生影响。此位点与体重(P<0.01)和去内脏重(P<0.01)呈显著相关性。与雄性相反,雌性半滑舌鳎个体的AB基因型个体的体重和去内脏重显著高于AA基因型(P<0.01),AB基因型的mRNA表达量也显著高于AA基因型(P<0.01)。另外,AB基因型个体在体高、性腺指数等方面高于AA基因型,但是这种变化无显著相关性(P>0.05)。这些结果显示,IGF1基因编码区的多态性可以作为一类很好分子标记用于遗传标记辅助选育。3.雌雄性半滑舌鳎IGF2基因SNP与mRNA表达和生长性状的相关性分析在鱼类中,类胰岛素生长因子2(IGF2)与其生长内分泌调控有关。研究发现雄性半滑舌鳎1GF2基因有两个突变(多态性1和多态性2),通过这两个突变建立了四个二倍型(D1、D2、D3和D4)。但是,多态性1在翻译过程中修复了。多态性2对于体重(P<0.01)、去内脏重(P<0.01)和肝重(P<0.05)有着显著影响。T检验结果表明,多态性2的AA基因型个体的体重(P<0.01)、去内脏重(P<0.01)和肝重(P<0.05)显著高于AB基因型。二倍型个体D2和D4的体重(P<0.05)、去内脏重(P<0.01)显著高于D1。AA基因型个体的总蛋白(TP)显著高于AB基因型个体(P<0.05)。除此以外,AA基因型个体的mRNA表达水平也显著高于AB基因型个体(P<0.01)。二倍型个体D2和D4的相关表达水平也是显著高于D1(P<0.05)。雌性半滑舌鳎的多态性位点1与雄性相同,无多态性位点2。综上所述,半滑舌鳎IGF2基因编码区的多态性的研究表明,雄性IGF2基因的SNP与生长性状、血液生化和基因表达显著相关,本研究对于鱼类生长分子生物学的研究具有一定的参考价值。
摘要第5-7页
Abstract第7-9页
引言第13-15页
第一章 文献综述第15-24页
    1 半滑舌鳎的简介第15-16页
        1.1 半滑舌鳎的生物学特性第15页
        1.2 半滑舌鳎的研究现状第15-16页
    2 分子标记及其检测方法第16-19页
        2.1 分子标记的研究第16-17页
        2.2 SNP的研究及检测方法第17-19页
    3 基因SNP与生长和表达的研究第19-21页
        3.1 IGF1和IGF2基因的结构和功能第19-20页
        3.2 鱼类IGF1基因SNP与生长和表达相关性第20页
        3.3 鱼类IGF1基因SNP与生长和表达的相关性第20-21页
    4 鱼类血液生理生化的研究第21-22页
        4.1 鱼类的血液生理生化指标第21页
        4.2 鱼类的血液生理生化的影响因素第21-22页
        4.3 基因多态性与血液生理生化相关性的研究进展第22页
    5 本研究的立项依据与研究意义第22-24页
第二章 雄性半滑舌鳎IGF1基因的SNP与mRNA表达和生长性状的相关性分析第24-37页
    1 材料和方法第25-29页
        1.1 材料第25页
        1.2 方法第25-29页
        1.3 统计学分析第29页
    2 结果第29-34页
        2.1 DNA提取及纯度检测第29页
        2.2 PCR检测结果第29-30页
        2.3 PCR-SSCP检测第30页
        2.4 各基因型序列第30-31页
        2.5 突变位点的基因结构第31页
        2.6 基因型和性状的相关性分析第31-33页
        2.7 血液生理生化与性状的相关性分析第33页
        2.8 基因的表达和相关性分析第33-34页
    3 讨论第34-36页
    4 小结第36-37页
第三章 雌性半滑舌鳎IGF1基因SNP与mRNA表达和生长性状的相关性分析第37-45页
    1 材料和方法第37-38页
        1.1 材料第37页
        1.2 方法第37-38页
        1.3 统计学分析第38页
    2 结果第38-43页
        2.1 DNA提取及纯度检测第38页
        2.2 PCR扩增第38-39页
        2.3 PCR-SSCP检测第39-40页
        2.4 各基因型序列第40页
        2.5 突变位点的基因结构第40-41页
        2.6 基因型和性状的相关性分析第41-42页
        2.7 表达结果第42-43页
    3 讨论第43-44页
    4 小结第44-45页
第四章 雌雄性半滑舌鳎IGF2基因SNP与mRNA表达和生长性状的相关性分析第45-60页
    1 材料和方法第46-47页
        1.1 材料第46页
        1.2 方法第46-47页
        1.3 统计学分析第47页
    2 结果第47-56页
        2.1 DNA提取及纯度检测第47-48页
        2.2 琼脂糖检测结果第48页
        2.3 IGF2基因编码区域的多态性第48-50页
        2.4 基因型频率和二倍体基因型频率第50-51页
        2.5 多态性与生长性状的相关性第51-54页
        2.6 基因型与血液生化指标的关系第54页
        2.7 不同基因型的mRNA 的表达情况第54-56页
        2.8 不同基因型的DNA和cDNA序列比较第56页
    3 讨论第56-59页
    4 小结第59-60页
参考文献第60-71页
附录第71-72页
致谢第72-73页
个人简历第73页
发表学术论文第73页
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