中国海洋红藻分子系统发育初步分析及石花菜目的分类学研究

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红藻门中的很多类群都是经济海藻,在海藻工业、海藻化学、水产养殖中发挥着重要的作用。《中国海藻志》的陆续出版表明我国海藻传统分类学研究有着深厚的研究基础。近年来藻类分子系统学的研究开启了藻类分类学的另一扇大门,并取得了一系列重要的成果。然而,我国海藻分子系统学的研究基础却非常薄弱。为此,作者进行了多次野外红藻资源调查,样品采集点覆盖了我国四大海藻区系,采集样品1038号,共有133个物种成功扩增序列617条;其中,rbcL序列318条,分布在15目、29科、44属、91个物种(包括未确定种名的物种25个),COI序列299条,分布在13目、26科、48属、96个物种(包括未确定种名的物种25个);这些序列为我国红藻分子系统学的研究提供了基础数据,也为全球其它相关海藻区系的红藻分子系统学研究提供了重要的参考资料。同时,揭示了12个分类单元将来可能描述为我国的新纪录种或新种。通过48个物种97个样品的rbcL+COI组合序列构建了我国红藻分子系统发育树,初步分析了我国海洋红藻类群目、科级的系统发育关系,从分子生物学的视角初步反映了我国海洋红藻系统的面貌,并由此跟随国际上藻类分类系统的变化,修订了8个分类单元。在以上分子系统发育分析的基础上,针对重要经济海藻石花菜目类群,系统的开展了形态学和分子系统发育学研究,分析了我国石花菜科、鸡毛菜科的种属关系。新增了我国石花菜目1个新记录属:阿凡达藻属Aphanta Tronchin&Freshwater,描述了4个新种,分别是红海湾石花菜Gelidium honghaiwanense G.C.Wang et X.L.Wang sp.nov.、杨梅坑石花菜Gelidium yangmeikengense G.C.Wang et X.L.Wang sp.nov.、三亚石花菜Gelidium sanyaense G.C.Wang et X.L.Wang sp.nov.和亚洲阿凡达藻Aphanta asiatica G.C.Wang et X.L.Wang sp.nov.;修订Gelidium tsengii为Gelidium johnstonii的同物异名;分析了细毛石花菜类群形态变异特征。分析了我国石花菜目的分子系统发育关系,揭示我国石花菜目类群应为3个科5个属,并在此基础上修订了我国石花菜目类群的分科检索表和分属检索表。
致谢第4-5页
摘要第5-6页
Abstract第6-7页
第一章 引言第10-25页
    1.1 中国海洋红藻生物多样性及分类学简史第10-13页
        1.1.1 中国海岸线特点及海藻区系划分第10-11页
        1.1.2 中国红藻资源及用途第11-12页
        1.1.3 中国海洋藻类分类学的研究简史与现状第12-13页
    1.2 DNA条码技术及红藻分子系统学研究进展第13-17页
        1.2.1 DNA条形码技术在海洋红藻鉴定中的应用第13-15页
        1.2.2 红藻分子系统学研究进展第15-17页
    1.3 石花菜目分类学研究第17-23页
        1.3.1 石花菜目的确立及其分类单元第17-19页
        1.3.2 石花菜目物种多样性及地理分布第19-21页
        1.3.3 石花菜目分类学研究进展第21-23页
    1.4 本论文研究内容及意义第23-25页
        1.4.1 研究内容第23页
        1.4.2 研究意义第23-25页
第二章 中国海洋红藻分子系统发育分析第25-57页
    引言第25-26页
    2.1 材料与方法第26-31页
        2.1.1 样品采集与处理第26页
        2.1.2 形态学特征观察第26页
        2.1.3 分子数据的获取第26-29页
        2.1.4 数据保存第29页
        2.1.5 数据分析第29-31页
    2.2 结果第31-50页
        2.2.1 样品采集地的广泛性第31-32页
        2.2.2 物种鉴定第32页
        2.2.3 DNA序列数据第32-33页
        2.2.4 基于分子数据分析的中国海洋红藻多样性评估第33-48页
        2.2.5 我国海洋红藻目级分子系统发育初步分析第48-50页
    2.3 讨论第50-57页
        2.3.1 我国海洋红藻分子系统发育初步分析:需要修订的分类单元第50-52页
        2.3.2 我国海洋红藻12个拟新记录种或新物种第52-57页
第三章 基于形态和分子数据的我国石花菜目的研究第57-110页
    前言第57-59页
    3.1 材料与方法第59-61页
        3.1.1 样品采集第59-60页
        3.1.2 形态鉴定第60页
        3.1.3 DNA提取、序列测定及系统发育分析第60-61页
    3.2 结果第61-102页
        3.2.1 亚圆形石花菜Gelidium tsengii的分类地位修订及红海湾石花菜Gelidiumhonghaiwanense G. C. Wang et X. L. Wang sp. nov第61-72页
        3.2.2 杨梅坑石花菜Gelidium yangmeikengense G. C. Wang et X. L. Wang sp. nov.和三亚石花菜Gelidium sanyaense G. C. Wang et X. L. Wang sp. nov第72-86页
        3.2.3 细毛石花菜Gelidium crinale和匍匐石花菜Gelidium pusillum第86-96页
        3.2.4 鸡毛菜科的系统发育关系及一新记录属阿凡达藻属Aphanta Tronchin & Freshwater及亚洲阿凡达藻Aphanta asiatica G. C. Wang et X. L. Wang sp. nov第96-102页
    3.3 讨论第102-110页
        3.3.1 红海湾石花菜、杨梅坑石花菜、三亚石花菜第102-106页
        3.3.2 亚圆形石花菜修订为约翰石花菜的同物异名第106-107页
        3.3.3 细毛石花菜和匍匐石花菜第107-109页
        3.3.4 亚洲阿凡达藻和厚根阿凡达藻的比较第109-110页
第四章 中国石花菜目的初步修订第110-120页
    引言第110-111页
    4.1 材料与方法第111-112页
        4.1.1 样品采集与形态鉴定第111-112页
        4.1.2 DNA提取、序列测定及系统发育分析第112页
    4.2 结果第112-118页
        4.2.1 rbcL基因系统发育分析第112-114页
        4.2.2 COI基因系统发育分析第114-116页
        4.2.3 我国石花菜目新增类群及分科、分属检索表修订第116-118页
    4.3 讨论第118-120页
        4.3.1 中国石花菜目物种多样性评估第118-120页
结论第120-121页
参考文献第121-138页
作者简历第138-139页
已发表或完成的论文目录第139-140页
附录第140-151页
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