苦荞在我国具有悠久的栽培历史,并且是唯一可以药食兼用的作物。在我国四川、云南、贵州及西藏等西南地区具有丰富的苦荞资源。然而我国对苦荞资源未充分开发利用,苦荞保存的资源没有作完全的鉴定,使苦荞研究存在很大的空缺。本研究通过课题组自主开发并设计合成500对SSR引物,对17个不同地理来源的166份苦荞种质资源的遗传多样性进行评估。在苦荞上的有效性约50%,多态率达10.8%,PIC平均值为0.4537。利用其中多态性丰富的28对SSR引物,在苦荞核心种质中检测出等位基因85个,每位点的等位基因数为2-5个,平均3.0个。通过聚类分析,将166份苦荞材料聚类为3大组。不同地理来源的苦荞种质资源的Shannon-Weaver多样性指数为0.3633～0.6671,来自云南、四川和西藏的苦荞材料不但遗传多样性丰富,而且亲缘关系较近,进一步证实苦荞起源于中国西南部。通过本研究为进一步开展苦荞种质资源的遗传多样性研究提供了参考,为拓宽苦荞种质资源的遗传多样性提供一定的理论依据,有助于有用基因发掘和分子标记辅助育种研究。苦荞已经成为公认的健康食品。苦荞中含有丰富的黄酮成分,对人体的多种疾病治疗有明显的效果。然而对苦荞中黄酮合成调控的关键酶之一查尔酮异构酶还处于未知状况。本研究根据NCBI网站公布的苦荞查尔酮异构酶的部分序列设计特异性引物,利用Genome-Walking技术设计了3条特异引物扩增苦荞Chs基因DNA的3’端和5’端的未知序列,经序列测定和拼接,扩增得到了苦荞CHI基因的长度为1610bp的序列,并扩增35份苦荞材料的查尔酮异构酶基因的序列多样性。利用软件比对材料查尔酮异构酶基因的序列,分析其序列多样性,发现7个SNP,13个In/del缺失位点。说明查尔酮异构酶基因的序列比较保守。对35苦荞材料进行连锁分析,P>0.1,说明差异不显著。进一步构建系统进化树,分析种内、种间CHI基因的系统进化方式。
