复杂网络模块之间的相互作用

复杂网络论文 多元社团论文 拓扑模块论文
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近几年,复杂网络社团结构的研究取得了许多新的进展。最近研究表明拓扑模块与功能模块是不同的概念。网络的拓扑模块仅仅代表网络静态的结构属性,一般来说只是说明网络中节点在某个局部的密集程度要高于其外围部分。然而,网络的功能模块是指具有相关功能的多个个体所构成的集合体。我们认识到拓扑是基础,功能是其修正。拓扑结构是网络的基本框架,只有软件与硬件的充分的结合才能产生有意义的功能。因而,将拓扑和功能有机地结合起来作为一个整合系统进行统一的研究,对于有效刻画复杂系统将是一个很有效的方案。另外,考虑到现实网络系统节点的多重角色和连接关系的多元化,我们考虑了具有重叠社团的多元网络。在本论文中,我们区分了拓扑意义和功能意义下的社团相互作用情况。在拓扑意义下,我们研究模块之间的相互作用。由简单到复杂,我们依次递进深入研究了密切相连的三个问题:首先,我们将两个模块看作为均质结构,忽略了模块具体的拓扑连接形式,研究了两个均质模块间的相互作用,讨论了拓扑模块之间如何通过公共部分发挥作用或影响。其次,我们主要考虑网络等级结构中的节点权值和边权值两个重要特征。研究了两个等级模块间的相互作用。通过数值模拟比较了随机网络和无标度网络的差异。最后,从相互耦合的社团网络入手,讨论了公共社团的结构的复杂性:节点的多重角色和关系连接多元性,我们研究了多元耦合模块间作用。在功能意义下,我们通过整合拓扑和功能信息,研究了模块之间的相互影响以及如何有效区分多元模块的划分。我们依次深入研究了相联系的两个问题:首先,我们研究了两个动态模块间相互作用。我们引进了类似可逆生化反应的“解体-合作”模型,用马尔科夫随机过程表示重叠与非重叠社团之间连接关系的状态变化,通过解析方法解释两个社团之间的相互作用的动态变化过程。接着,我们整合网络的拓扑和功能,研究了如何有效区分多元模块的划分。考虑到节点状态的动态变化,我们以节点状态的动态变化作为网络功能的度量,进而提出了一个连接关系的相似度指标,该指标度量了由同一状态所促使的对应关系的相似性程度。应用该指标,结合网络的拓扑可以明确判定重叠社团部分参与不同功能模块的具体情况,就可以很容易地将多元共存网络的不同类型关系下的社团结构区分开来。
摘要第8-9页
ABSTRACT第9页
目录第11-14页
第一章 绪论第14-38页
    1.1 复杂性与复杂系统第14-16页
    1.2 复杂网络概述第16-18页
    1.3 复杂网络研究的重要性第18-21页
        1.3.1 复杂网络在社会系统中第18-19页
        1.3.2 复杂网络在生物系统中第19-21页
    1.4 复杂网络中的社团结构研究进展第21-22页
        1.4.1 社团结构研究进展第21页
        1.4.2 多元耦合社团网络研究进展第21-22页
    1.5 复杂网络中的基本概念第22-28页
        1.5.1 复杂网络的描述第22页
        1.5.2 复杂网络系统特征第22-23页
        1.5.3 复杂网络度量指标第23-27页
            1.5.3.1 度和度分布第23页
            1.5.3.2 平均路径长度第23-24页
            1.5.3.3 集聚系数第24页
            1.5.3.4 介数(Betweenness)第24-25页
            1.5.3.5 度关联性第25页
            1.5.3.6 社团划分指标第25-26页
            1.5.3.7 网络中心性指标第26-27页
        1.5.4 复杂网路中的社团结构(Community Structure)第27-28页
    1.6 网络模型分类第28-30页
        1.6.1 随机网络(Random Network)第28-29页
        1.6.2 小世界网络(Small World Network)第29-30页
        1.6.3 无标度网络(Scale Free network)第30页
    1.7 社团结构分析第30-34页
        1.7.1 以节点信息进行划分第31页
        1.7.2 以边信息进行划分第31-33页
        1.7.3 最新研究进展第33-34页
    1.8 本论文的特色第34-38页
        1.8.1 多模块之间存在交集第34页
        1.8.2 拓扑模块与功能模块区分开讨论第34-38页
            1.8.2.1 在拓扑意义下本论文的研究情况第35-36页
            1.8.2.2 在功能意义下本论文的研究情况第36-38页
第二章 拓扑结构角度研究多元社团间的相互影响第38-66页
    2.1 本章概述第38页
    2.2 两个均质模块间的相互作用第38-48页
        2.2.1 引言第38-41页
        2.2.2 度量指标第41-43页
            2.2.2.1 社团间相互路径强度第41页
            2.2.2.2 A社团节点的接近点密度第41-43页
            2.2.2.3 社团A对社团B的影响强度第43页
        2.2.3 两个模块相互作用解释回避制度第43-47页
        2.2.4 数据模拟第47页
        2.2.5 讨论第47-48页
        2.2.6 本节小结第48页
    2.3 两个等级模块间的相互作用第48-54页
        2.3.1 引言第48-49页
        2.3.2 结合等级结构构造新的影响强度指标第49-50页
        2.3.3 结合特定网络结构进行模拟第50-52页
        2.3.4 本节小结第52-54页
    2.4 多元耦合社团网络间的相互影响第54-66页
        2.4.1 引言第54页
        2.4.2 公共社团内公共节点的多重角色第54-56页
        2.4.3 公共社团内连接关系的多重性与协同效应第56-57页
        2.4.4 耦合社团之间影响强度度量第57-58页
            2.4.4.1 潜在桥数第57页
            2.4.4.2 传播能力Communication第57-58页
            2.4.4.3 控制能力Controbility第58页
            2.4.4.4 综合指标第58页
        2.4.5 实例分析第58-59页
            2.4.5.1 比较公共节点度变化第59页
            2.4.5.2 比较公共节点个数变化第59页
            2.4.5.3 比较公共边数目变化第59页
        2.4.6 指标的有效性检验第59-63页
        2.4.7 讨论与总结第63-66页
第三章 功能角度研究多元社团间的相互影响第66-84页
    3.1 本章概述第66页
    3.2 动态网络中两个功能模块之间的作用第66-76页
        3.2.1 引言第66-67页
        3.2.2 公共节点与非公共节点连接边的动态变化第67-69页
        3.2.3 公共社团内部合作体“解体-合作”之间的动态变化过程第69-71页
        3.2.4 模型分析第71-76页
        3.2.5 本节小结第76页
    3.3 整合拓扑和功能信息区分多元功能社团划分第76-84页
        3.3.1 引言第76-77页
        3.3.2 模型与算法第77-80页
        3.3.3 实例说明与分析第80-82页
        3.3.4 本节小结第82-84页
第四章 总结和展望第84-86页
    4.1 全文总结第84-85页
    4.2 展望第85-86页
参考文献第86-94页
攻读博士学位期间完成的工作第94-96页
致谢第96页
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