中亚滨藜盐诱导基因BADH cDNA片段的克隆、特性分析及中亚滨藜基因组文库的构建

甘氨酸甜菜碱论文 胆碱单氧化物酶论文 甜菜碱醛脱氢酶论文 RT-PCR论文 Southern杂交论文
论文详情
某些高等植物(如藜科、禾本科等)中的植物在盐、旱等渗透胁迫条件下,合成并积累甘氨酸甜菜碱作为非毒性的渗透保护物质。一般认为甘氨酸甜菜碱除了作为渗透物质增加渗透压力外,还能保护酶和膜免受高盐的损伤。在高等植物中,甘氨酸甜菜碱的合成是在叶绿体中进行的,经由以下途径:胆碱—→甜菜碱醛—→甘氨酸甜菜碱。其中催化第一步反应的酶为胆碱单氧化物酶(CMO),第二步反应由甜菜碱醛脱氢酶(BADH)催化。 根据已发表的几种植物的BADH的cDNA序列设计了一对引物,通过RT-PCR方法,从中亚滨藜中扩增了甜菜碱醛脱氢酶的近5’端的序列,共393bp,与菠菜、山菠菜等BADH cDNA相应区域有着较高的同源性。以获得的BADH的cDNA片段为探针,对中亚滨藜的基因组进行Southern杂交分析,证明该基因可能是单拷贝的。Northern印迹杂交结果表明:250mM NaCl处理的植株的BADH mRNA水平比对照植株高约2—3倍,说明BADH基因的表达受盐诱导。此外,本论文还以λEMBL3/BamHI为载体极建了中亚滨藜的基因组文库,文库的原始滴度约为4×10~6pfu/ml,插入片段的大小约为16Kb。构建文库的目的是为了筛选BADH基因的启动子区。
中文摘要第4-5页
英文摘要第5页
第一部分 文献综述第7-19页
    前言第7-8页
    一、 甜菜碱的代谢途径及其调控第8-12页
        1. 原核生物E.coli中甜菜碱的代谢及调控第8-10页
            1.1 甜菜碱的合成及其转运第8-10页
            1.2 甜菜碱合成途径的调控及信号传导第10页
        2. 高等植物中甜菜碱的代谢及调控第10-12页
            2.1 甜菜碱的合成第11页
            2.2 甜菜碱醛脱氢酶(BADH)第11-12页
            2.3 基因调控及信号传导第12页
    二、 启动子第12-19页
        1. 高等植物启动子第12-15页
            1.1 双向启动子第13页
            1.2 环境诱导表达的启动子第13-14页
            1.3 组织特异表达的启动子第14-15页
        2. 启动子克隆策略第15-19页
            2.1 基于杂交技术的启动子克隆策略第15页
            2.2 基于PCR的启动子克隆策略第15-19页
第二部分 实验材料与方法第19-30页
    一、 实验材料第19-20页
        1. 中亚滨藜的种植及处理第19页
        2. 菌株、质粒及其它载体第19页
        3. 培养基及抗生素第19页
        4. 酶及其他试剂第19页
        5. 所用的主要仪器、设备第19-20页
    二、 实验方法第20-30页
        1. 植物DNA提取方法(CTAB法)第20-21页
        2. 异硫氰酸胍裂解法(GIT)提取植物叶片总RNA第21页
        3. mRNA反转录第21-22页
        4. 质粒DNA的小量制备(碱法)第22页
        5. T-载体的制备及与外源片段的连接第22页
        6. 感受态细胞的制备及转化第22-23页
        7. 基因组Southern杂交第23-24页
        8. Northern印迹杂交第24-25页
        9. 基因组文库的构建第25-30页
第三部分 结果分析与讨论第30-42页
    一、 结果分析第30-40页
        1. 中亚滨藜BADH cDNA近5'端片段的克隆第30-34页
            1.1 引物的设计第30页
            1.2 RT-PCR的扩增第30-33页
            1.3 PCR产物的克隆第33-34页
        2. 序列分析第34-36页
            2.1 所克隆的BADH cDNA片段的测序结果第34页
            2.2 与其他几种植物的BADH的相应片段的同源性比较第34-36页
        3. 基因组DNA的Southern杂交分析第36页
        4. Northern印迹杂交分析第36-37页
            4.1 杂交结果第36-37页
            4.2 结果分析第37页
        5. 中亚滨藜基因组文库的构建第37-40页
            5.1 中亚滨藜基因组DNA的检测第37-38页
            5.2 部分酶切第38-39页
            5.3 片段选择第39页
            5.4 原始文库滴度的测定第39-40页
    二、 讨论第40-42页
参考文献第42-46页
致 谢第46页
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