Rhodococcus sp.R04细胞色素P450单加氧酶多态性及CYP125的功能研究

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细胞色素P450单加氧酶(Cytochrome P450,CYP),是一类催化单加氧反应酶的超家族,它广泛地存在于从低等的微生物到高等的哺乳动物等各种生命体中。CYP具有代谢众多生命体内源和外源性物质的功能。这类酶能表现出特殊的光谱性质,其还原态与CO结合后,能在450nm处产生特征吸收峰,这也是P450得名的缘由。Rhodococcus sp. R04基因组测序发现,Rhodococcus sp. R04中含有至少15种细胞色素P450单加氧酶,它们分别从属于13个家族,并由Cytochrome P450命名委员会予以命名,它们分别是CYP102C3、CYP116B4、CYP123A6、CYP125A18、CYP125B2、 CYP136C4、 CYP136C5P、CYP150A16、CYP152F1、CYP153A32、CYP185B1、 CYP186C1、CYP255A3、CYP255A4和CYP51B1.通过序列比对发现这15种细胞色素P450单加氧酶的总相似性仅有14.64%,但其比对结果显示所有的P450酶都具有保守的螺旋K区"EXXR"与血红素结合区"FGXGXXXCXG".系统发育分析表明,CYP125A18、CYP125B2与Rhodococcus sp.RHA1和Mycobacterium tuberculosis中的CYP为同一族群,而该族群被证实能催化cholest-4-en-3-one的27位碳原子并能进入细胞质中催化胆固醇侧链的碳原子,另外CYP125家族与Pseudomonas sp的P450terp有相同的起源,此酶具有α-松油醇羟化酶活性。基因注释表明,Rhodococcus sp. R04中有两种CYP125,分别是CYP125B2和CYP125A18.我们对这两种CYP125进行了克隆、表达纯化以及相关性质的研究。结果表明,氧化态CYP125B2和CYP125A18在417.5和422nm出现特征吸收峰,还原态CYP125B2和CYP125A18与CO结合后,与氧化态的差示光谱显示它们在450和458nm会产生差示峰,这与一般的细胞色素P450单加氧酶的典型特征相同。同时运用光学滴定法测定克霉唑,硝酸益康唑,甲硝唑,酮康唑,4-苯基咪唑和4-甲基-2-苯基咪唑六种不同的唑类药物与CYP125B2和CYP125A18的相互作用,并计算Kd值,分析这几种唑类药物分别与CYP125B2和CYP125A18的结合程度,实验结果表明CYP125B2与六种唑类药物的结合程度依次是4-苯基咪唑>硝酸益康唑>克霉唑>酮康唑>4-甲基-2-苯基咪唑>甲硝唑,而CYP125A18是酮康哗>硝酸益康唑>克霉唑>4-甲基-2-苯基咪唑>甲硝唑>4-苯基咪唑。目前,我们已经发现Rhodococcus sp. R04能够在以胆固醇为唯一碳源的培养基上生长,并且能将胆固醇转化,但所生成物质的结构尚不明确。另外,据报道CYP125在降解胆固醇,类固醇等脂肪族化合物中起关键作用。我们推测Rhodococcus sp. R04中的CYP125B2和CYP125A18两种CYP125参与了Rhodococcus sp. R04降解胆固醇的途径,但它们在这一过程中的具体作用还是未知的,尚需进一步的实验证明。
中文摘要第10-12页
ABSTRACT第12-14页
第一章 文献综述第15-33页
    1 细胞色素P450单加氧酶概述第15-16页
    2 细胞色素P450单加氧酶的结构第16-18页
    3 细胞色素P450单加氧酶的功能第18-26页
        3.1 细胞色素P450的催化机制第18-21页
        3.2 细胞色素P450催化的反应类型第21-26页
    4 P450转化胆固醇第26-27页
    5 细胞色素P450单加氧酶的多样性第27-29页
        5.1 细胞色素P450单加氧酶的类型第28页
        5.2 细胞色素P450单加氧酶的命名第28-29页
    6 本论文研究的目的和意义第29页
    参考文献第29-33页
第二章 Rhodococcus sp.R04中细胞色素P450单加氧酶多态性第33-41页
    1 Rhodococcus sp.R04中细胞色素P450概况第33-35页
    2 Rhodococcus sp.R04中CYP序列分析第35-38页
        2.1 Rhodococcus sp.R04中CYP一级结构序列比对第35-36页
        2.2 CYP系统发育分析第36-38页
    3 讨论第38-39页
    参考文献第39-41页
第三章 Rhodococcus sp.R04 CYP125B2的表达纯化和部分性质研究第41-54页
    1 材料第41-42页
        1.1 菌株和载体第41-42页
        1.2 培养基第42页
        1.3 主要的酶和化学试剂第42页
        1.4 主要的仪器设备第42页
    2 方法第42-45页
        2.1 Rhodococcus sp.R04细胞色索单加氧酶基因cyp125B2的克隆第42页
        2.2 cyp125B2基因的表达第42-44页
        2.3 细胞色素P450单加氧酶CYP125B2的纯化第44页
        2.4 蛋白含量测定第44-45页
        2.5 CYP125B2的紫外可见光谱扫描第45页
        2.6 CYP125B2的唑类药物滴定第45页
    3 结果第45-50页
        3.1 Rhodococcus sp.R04中cyp125B2基因的扩增及重组子的鉴定第45-46页
        3.2 CYP125B2的表达纯化第46-47页
        3.3 CYP125B2的紫外可见光谱分析第47-48页
        3.4 CYP125B2的哗类药物滴定分析第48-50页
    4 讨论第50-51页
    参考文献第51-54页
第四章 Rhodococcus sp.R04 CYP125A18的表达纯化和部分性质研究第54-65页
    1 材料第55-56页
        1.1 菌株和载体第55页
        1.2 培养基第55页
        1.3 主要的酶和化学试剂第55页
        1.4 主要的仪器设备第55-56页
    2 方法第56-58页
        2.1 Rhodococcus sp.R04细胞色素单加氧酶基因cyp125A18的克隆第56页
        2.2 cyp125A18基因的表达第56-57页
        2.3 细胞色素P450单加氧酶CYP125A18的纯化第57页
        2.4 蛋白含量测定第57页
        2.5 CYP125A18的紫外可见光谱扫描第57-58页
        2.6 CYP125A18的唑类药物滴定第58页
    3 结果第58-62页
        3.1 Rhodococcus sp.R04中cyp125A18基因的扩增及重组子的鉴定第58页
        3.2 CYP125A18的表达纯化第58-59页
        3.3 CYP125A18的紫外可见光谱分析第59-60页
        3.4 CYP125A18的唑类药物滴定分析第60-62页
    4 讨论第62-63页
    参考文献第63-65页
第五章 Rhodococcus sp.R04转化胆固醇的研究第65-74页
    1 材料第65-66页
        1.1 菌株来源第65页
        1.2 实验仪器与试剂第65-66页
        1.3 培养基第66页
    2 方法第66-67页
        2.1 菌株的活化及培养第66页
        2.2 胆固醇降解分析第66-67页
    3 结果第67-70页
        3.1 菌株的生长情况第67页
        3.2 菌株降解胆固醇的HPLC分析第67-70页
    4 讨论第70-72页
    参考文献第72-74页
小结第74-76页
攻读学位期间取得的研究成果第76-77页
致谢第77-78页
个人简况及联系方式第78-80页
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