黄颡鱼IgM分子及其表达研究

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黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco Richardson)是我国重要的淡水养殖鱼类,对其免疫系统的研究不仅在黄颡鱼及其它鱼类病害防治方面具有重要价值,而且在脊椎动物比较免疫及免疫发生方面也具有重要意义。本论文对编码黄颡鱼免疫球蛋白(Ig)M重链(H)和轻链(L)基因cDNA进行了克隆,并研究了IgM的表达规律及其传递和个体发生运用RT和RACE PCR方法扩增出黄颡鱼IgM重链(ycIgM)和免疫球蛋白轻链(ycIgL) L1、L2和L3全长cDNA。 yclgM cDNA全长为1993bp,包含5’非编码区42bp,3’非编码区229bp,开放阅读框1722bp,编码573个氨基酸。ycIgL1cDNA全长为1021bp,包含5’非编码区39bp,3’非编码区259bp,开放阅读框723bp,编码240个氨基酸。ycIg L2cDNA全长为953bp,包含5’非编码区57bp,3’非编码区164bp,开放阅读框732bp,编码243个氨基酸。ycIg L3cDNA全长为965bp,包含5’非编码区58bp,3’非编码区184bp,开放阅读框723bp,编码240个氨基酸。序列比对分析表明ycIgM、ycIgL1ycIgL2和ycIgL3基因与斑点叉尾鯝的相似性最高为52.3%、90.%、80.2%和68.9%,并在进化树中分别与斑点叉尾鯝的IgM、IgL-G、IgL-2和IgL-F聚为一支。RT-PCR表明yclgM基因主要在头肾、中肾、脾脏和血液中表达,而在心脏、肌肉和脑中表达量很少。ycIg L1基因主要在头肾、脾脏、鳃、肠和血液表达,在肌肉、皮肤和脑中表达量很少;L2基因主要在头肾、脾脏、鳃、肠和血液表达,在心脏和脑中表达量很少;L3基因主要在脾脏、鳃、肠、肝和血液中表达,而在心脏和脑中表达量很少。Real-time PCR分析表明,注射嗜水气单胞菌后,ycIgM基因在黄颡鱼头肾、脾脏、肝和血液表达量在15d有显著上升,而在肠组织中5d内显著增加,15d恢复到刺激前水平。原位杂交分析表明,ycIgM基因阳性细胞出现在头肾、脾脏、鳃和肠组织中,注射嗜水气单胞菌15d后,头肾和脾脏组织中阳性细胞明显增加。而此时肝脏组织中也开始检测到了ycIgM基因阳性细胞。通过原核表达载体pQE30,利用IPTG诱导,在大肠杆菌表达菌株M15获得大量可溶ycIgM蛋白。以纯化后的重组ycIgM蛋白为抗原,免疫新西兰兔制备了抗ycIgM蛋白的多克隆抗血清,ELISA测定抗血清效价约为1:512000; Western blot分析显示IgM在健康黄颡鱼头肾、脾脏、血清、皮肤、鳃、肠、肝和中肾中表达;免疫组化分析表明,ycIgM蛋白阳性信号出现在头肾、脾脏、鳃、肠和肝脏组织中,注射嗜水气单胞菌15d后,在这些组织中阳性信号有不同程度的变化。免疫荧光分析表明丰富的ycIgM蛋白荧光信号出现在头肾、脾脏、鳃、肠和肝脏组织中。利用RT-PCR和Real-time PCR技术,在黄颡鱼卵和胚胎中检测到ycIgM mRNA。胚胎孵化后14d时仔鱼匀浆中检测到ycIgM mRNA,而在3-7d内没有检测到。利用Elisa技术,在黄颡鱼卵、胚胎、仔鱼各时间点都检测到yclgM蛋白,而且逐渐下降,在孵化9d蛋白表达量最低,到14d蛋白表达开始上升。这些研究表明,ycIgM mRNA和蛋白在仔鱼早期没有合成,存在于早期仔鱼的ycIgM蛋白来自于亲体。
摘要第9-11页
Abstract第11-13页
第一章 文献综述第14-38页
    第一节 研究概况与进展第14-34页
        1 免疫组织与器官第14-16页
            1.1 头肾(Head kidney)第14-15页
            1.2 脾脏(Spleen)第15页
            1.3 胸腺(Thymus)第15页
            1.4 粘膜相关淋巴组织(Mucosa-associated lymphoid tissue,MALT)第15-16页
        2 淋巴细胞第16-17页
        3 免疫分子第17页
        4 免疫球蛋白第17-31页
            4.1 免疫球蛋白的基本结构第18-19页
            4.2 免疫球蛋白基因结构第19-21页
            4.3 免疫球蛋白的基因重排第21-22页
            4.4 鱼类免疫球蛋白多样性产生的遗传机制第22-24页
            4.5 免疫球蛋白的类别转换第24页
            4.6 免疫球蛋白的生物学功能第24-25页
            4.7 疫球蛋白分子类型的多样性第25-30页
            4.8 免疫球蛋白基因的进化第30-31页
        5 免疫球蛋白M的应答和发生研究进展第31-34页
            5.1 免疫球蛋白M的应答规律第31-33页
            5.2 免疫球蛋白M的个体发生第33-34页
    第二节 选题依据与意义第34-38页
第二章 黄颡鱼IgM基因cDNA克隆和序列分析第38-70页
    第一节 黄颡鱼IgM重链基因cDNA克隆和序列分析第38-53页
        1 材料与方法第38-47页
            1.1 实验动物第39页
            1.2 试剂和药品第39页
            1.3 主要试剂配制第39页
            1.4 细菌制备第39-40页
            1.5 分子克隆第40-46页
            1.6 测序第46-47页
            1.7 黄颡鱼IgM-H基因cDNA序列和系统进化分析第47页
        2 结果第47-53页
            2.1 黄颡鱼IgM重链基因cDNA序列第47-48页
            2.2 黄颡鱼IgM氨基酸序列分析第48-49页
            2.3 黄颡鱼IgM-H氨基酸序列的系统进化分析第49-53页
    第二节 黄颡鱼IgM轻链(IgL)基因cDNA克隆和序列分析第53-63页
        1 材料与方法第53-54页
            1.1 实验鱼、药品与试剂第53页
            1.2 黄颡鱼全长IgL cDNA的获得第53-54页
            1.3 黄颡鱼IgL基因cDNA序列和系统进化分析第54页
        2 结果第54-63页
            2.1 黄颡鱼IgL cDNA序列分析第54-57页
            2.2 黄颡鱼IgL氨基酸组成和序列分析第57-59页
            2.3 黄颡鱼与其他脊椎动物IgL的系统发育分析第59-63页
    第三节 讨论第63-70页
        1 IgM-H序列特征分析第63-66页
            1.1 IgM表现形式的多样性第64页
            1.2 IgM的保守基序第64页
            1.3 IgM铰链区第64-65页
            1.4 补体结合位点分析第65页
            1.5 糖基化位点第65-66页
        2 IgM-H的系统进化分析第66页
        3 黄颡鱼IgL cDNA和氨基酸序列第66-68页
        4 黄颡鱼与其它脊椎动物IgL序列的联系第68页
        5 Ig H与L之间的关系第68-70页
第三章 黄颡鱼IgM转录表达模式第70-92页
    第一节 黄颡鱼IgM基因转录表达的组织特异性第70-74页
        1 材料与方法第70-71页
            1.1 组织表达模式研究的引物设计第70页
            1.2 各组织总RNA的提取和第一链cDNA的合成第70页
            1.3 黄颡鱼IgM重链和轻链L1、L2及L3组织分布研究第70-71页
        2 结果第71-74页
            2.1 IgM重链基因组织表达模式第71-72页
            2.2 黄颡鱼IgL基因组织表达模式第72-74页
    第二节 黄颡鱼IgM基因转录表达的组织细胞定位第74-84页
        1 材料与方法第74-79页
            1.1 RNA探针的制备第74-76页
            1.2 试剂的配制第76-77页
            1.3 材料的固定第77页
            1.4 原位杂交第77-78页
            1.5 注射嗜水气单胞菌后IgM的细胞模式变化第78-79页
        2 结果第79-84页
            2.1 黄颡鱼IgM基因的细胞表达模式第79-82页
            2.2 注射嗜水气单胞菌后IgM阳性细胞的分布及密度变化第82-84页
    第三节 黄颡鱼IgM基因转录表达水平随时间的变化规律第84-87页
        1 材料和方法第84-85页
            1.1 样品采集第84页
            1.2 各组织总RNA的提取和第一链cDNA的合成第84-85页
            1.3 Real-time PCR分析第85页
        2 结果第85-87页
            2.2 Real-time PCR分析注射嗜水气单胞菌后IgM的转录表达变化第85-87页
    第四节 讨论第87-92页
        1 IgM-H的组织分布分析第87页
        2 黄颡鱼IgM-L基因的组织表达分析第87-88页
        3 IgM阳性细胞的研究第88-89页
        4 IgM对抗原的应答研究第89-92页
第四章 黄颡鱼IgM蛋白表达的时空模式第92-111页
    第一节 黄颡鱼IgM蛋白的组织细胞定位第92-104页
        1 材料与方法第92-96页
            1.1 实验材料与试剂第92-93页
            1.2 黄颡鱼IgM重链基因的原核表达第93-94页
            1.3 多杭的制备与效价测定第94页
            1.4 黄颡鱼IgM Western blotting第94-95页
            1.5 IgM蛋白的组织细胞定位第95-96页
        2 结果第96-104页
            2.1 黄颡鱼IgM在原核系统中的表达第96-97页
            2.2 多抗效价的测定第97页
            2.3 Western blotting检测IgM组织蛋白水平的表达第97-98页
            2.4 免疫组化分析IgM的组织细胞定位第98-104页
    第二节 黄颡鱼不同组织IgM蛋白水平随时间的表达变化规律第104-107页
        1 材料与方法第104页
            1.1 样品准备第104页
            1.2 间接ELISA检测黄颡鱼注射免疫后组织IgM蛋白水平变化第104页
        2 结果第104-107页
    第三节 讨论第107-111页
        1 抗体制备第107页
        2 表达分析第107-108页
        3 IgM的应答规律第108-109页
        4 免疫荧光和免疫组化分析IgM的在组织细胞定位第109-111页
第五章 黄颡鱼IgM传递和个体发生第111-121页
    第一节 黄颡鱼IgM的个体发生第111-116页
        1 材料和方法第111-112页
            1.1 实验鱼第111-112页
            1.2 RT-PCR分析黄颡鱼卵巢、胚胎和仔鱼IgM转录变化第112页
            1.3 Real-time分析卵巢、胚胎和仔鱼IgM转录变化第112页
            1.4 原位杂交分析幼鱼中IgM阳性信号第112页
        2 结果第112-116页
            2.1 RT-PCR分析第112-113页
            2.2 Real-time PCR分析第113-115页
            2.3 幼鱼中IgM阳性信号第115-116页
    第二节 黄颡鱼IgM的代间传递第116-117页
        1 材料和方法第116页
            1.1 样品准备第116页
            1.2 ELISA分析注射嗜水气单胞菌前后IgM蛋白在卵巢、胚胎和仔鱼中的含量变化第116页
        2 结果第116-117页
    第三节 讨论第117-121页
全文总结第121-123页
缩略语表第123-127页
参考文献第127-145页
致谢第145-147页
在读期间完成的论文第147-148页
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论文编号ABS559213,这篇论文共148页
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