深海沉积物微生物多样性研究及一株近海沉积物细菌多相分类鉴定

本研究采用非培养的方法,从太平洋海山富钴结壳区P20082站点、太平洋多金属结核区WS200801站点及印度洋热液硫化物区TVG19站点沉积物样品中直接抽提DNA,分别构建细菌和古菌16S rRNA文库,经测序及比对表明,三个站点的细菌文库分别涵盖了14、12、8个类群的细菌,包括变形菌门、疣微菌门、芽单胞菌门、拟杆菌门、浮霉菌门、酸杆菌门、放线菌门、硝化螺旋菌门、绿弯菌门、TM7、OP11、OD1、蓝细菌、脱铁杆菌门、厚壁菌门及衣原体门,三个站点优势类群均为变形菌门细菌。热液硫化物区站点古菌文库包括泉古菌门和广古菌门,而P20082站点和WS200801站点多样性较低,只有泉古菌门类群。从太平洋海山富钴结壳区样品中分离到一株钴锰耐受菌C5,经16S rDNA序列比对与Brachybacterium paraconglomeratum相似性为100%,锰最大耐受浓度为40 mM,钴最大耐受浓度为5 mM,推测可能为锰氧化菌。从苍南近海沉积物中分离到一株革兰氏阴性细菌CN85~T,通过传统分类、化学分类及分子生物学方法结合,对其进行鉴定,研究表明CN85~T是Microbulbifer属的新种。