珊瑚共附生可培养真菌菌群多样性及其生物活性研究

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本文从广东徐闻珊瑚礁国家级自然保护区采集8种珊瑚,用培养法分离纯化真菌,应用形态学观察与分子鉴定相结合的方法,进行珊瑚共附生真菌菌群多样性研究,并对分离的真菌菌株进行生物活性筛选。运用稀释平板法和基于internal transcribed spacer-rDNA (ITS-rDNA)基因序列的系统发育分析对珊瑚共附生可培养真菌多样性进行研究,将所得到的基因序列与NCBI数据库GenBank的序列进行相似性比较并构建系统发育树。实验中从8种珊瑚表面和内部共分离得到97株菌落形态各异的真菌。ITS-rDNA序列分析及形态学鉴定表明,珊瑚共附生真菌主要包括曲霉菌Aspergillus sp.、枝孢霉菌Cladosporium sp.、炭角菌Xylariales sp.、青霉菌Penicillium sp.、葡萄穗霉菌Stachybotrys sp.、赤霉菌Gibberella moniliformis、镰刀霉菌Fusarium sp.等。分离得到的菌株中,4-13与GenBank中已报道的基因序列的相似性仅为89%,可能是潜在的新属种。选取04丛生盔形珊瑚(Galaxea fascicularis)共附生可培养真菌进行抑菌活性和酶抑制活性筛选。采用96孔板培养法结合酶标仪测定。以6种常见的致病菌或致食品腐败的细菌为指示菌,对其共附生真菌次级代谢产物进行抗菌活性筛选,对抗菌能力及抗菌谱进行研究。结果表明:19株真菌均具有不同程度的抗菌活性。高活性菌株占52.63%,其中4-4、4-5两菌株表现出良好的抗菌活性。在酶抑制性实验中,有10株真菌对一种或两种酶具有抑制活性,其中曲霉属真菌效果良好,散囊属真菌4-12、枝孢霉4-20对乙酰胆碱酯酶的抑制效果超过了阳性对照石杉碱甲。粗提物样品对α-葡萄糖苷酶、乙酰胆碱酯酶有较好的抑制活性,说明具有抗老年痴呆、抗高血压活性。这对新药的研究开发提供了一定的理论基础,具有进一步的研究价值。结果表明,珊瑚共附生可培养真菌多样性较为丰富,潜在新的微生物菌种资源,并具有较好的生物活性,因此珊瑚共附生真菌具有良好的应用潜力和综合开发前景。
摘要第6-7页
Abstract第7页
1 绪论第10-18页
    1.1 海洋真菌研究概况第10-14页
        1.1.1 海洋真菌的定义及其多样性第10页
        1.1.2 微生物群落多样性的研究方法第10-12页
        1.1.3 海洋真菌活性物质第12-14页
        1.1.4 海洋微生物活性物质的筛选第14页
    1.2 珊瑚及珊瑚共附生真菌第14-16页
        1.2.1 珊瑚生物学特性第14-15页
        1.2.2 珊瑚共附生微生物第15-16页
    1.3 本课题主要研究内容第16-18页
        1.3.1 研究目的和意义第16-17页
        1.3.2 主要技术路线第17-18页
2 珊瑚共附生真菌的分离及形态学观察第18-31页
    2.1 材料第18-19页
        2.1.1 样品来源第18-19页
        2.1.2 培养基第19页
        2.1.3 海水第19页
    2.2 主要实验仪器与设备第19-20页
    2.3 实验方法第20页
        2.3.1 样品处理方法第20页
        2.3.2 珊瑚共附生真菌分离第20页
        2.3.3 菌株保存第20页
        2.3.4 样品编号第20页
        2.3.5 珊瑚共附生真菌形态学观察第20页
    2.4 结果与分析第20-29页
        2.4.1 珊瑚共附生真菌的分离第20-21页
        2.4.2 不同培养基上珊瑚共附生真菌的分离第21页
        2.4.3 样品中珊瑚共附生真菌的分布及种属第21-22页
        2.4.4 形态学观察第22-29页
    2.5 小结与讨论第29-31页
        2.5.1 本章小结第29页
        2.5.2 讨论第29-31页
3 04 丛生盔型珊瑚共附生真菌的ITS 序列分析第31-39页
    3.1 材料第31-32页
        3.1.1 菌株来源第31页
        3.1.2 主要试剂第31-32页
    3.2 主要仪器第32页
    3.3 实验方法第32-34页
        3.3.1 DNA 提取第32页
        3.3.2 扩增ITS-rDNA 的引物第32页
        3.3.3 ITS-rDNA 扩增第32-33页
        3.3.4 PCR 产物检测第33页
        3.3.5 ITS-rDNA 序列分析第33页
        3.3.6 种群多样性分析第33-34页
    3.4 结果与分析第34-37页
        3.4.1 ITS 扩增产物的电泳图谱第34页
        3.4.2 丛生盔型珊瑚共附生真菌的多样性分析第34页
        3.4.3 丛生盔型珊瑚共附生真菌的系统发育学分析第34-37页
    3.5 小结与讨论第37-39页
        3.5.1 本章小结第37页
        3.5.2 讨论第37-39页
4 04 丛生盔型珊瑚共附生真菌发酵粗提物生物活性筛选第39-46页
    4.1 材料第39页
        4.1.1 菌株来源第39页
        4.1.2 培养基第39页
        4.1.3 指示菌第39页
        4.1.4 主要试剂第39页
    4.2 主要仪器第39-40页
    4.3 实验方法第40-43页
        4.3.1 珊瑚共附生真菌次级代谢产物粗提物制备第40-42页
        4.3.2 抑菌实验第42页
        4.3.3 酶抑制性实验第42-43页
    4.4 结果与分析第43-45页
        4.4.1 抗菌活性菌株初筛选第43页
        4.4.2 活性菌株的抗菌能力比较第43-44页
        4.4.3 粗提物的酶抑制活性第44-45页
    4.5 小结与讨论第45-46页
        4.5.1 本章小结第45页
        4.5.2 讨论第45-46页
5 结论与展望第46-47页
    5.1 结论第46页
    5.2 展望第46-47页
参考文献第47-53页
附录:构建系统发育树的19 株菌株的ITS 测序序列第53-60页
致谢第60-61页
作者简历第61页
导师简介第61页
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