以肠道病毒71型3C蛋白酶为靶点的药物筛选模型的建立及药物筛选

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肠道病毒71型EV71、柯萨奇病毒等肠道病毒引起的手足口病是一种常见的病毒性传染病,其中EV71引起的手足口病发生重症比例较大,致死率高,所引起的神经系统并发症可导致死亡或永久性肌麻痹,严重威胁儿童健康。手足口病是全球性传染病,世界大部分地区均有此病流行的报道。我国自1981年在上海发现本病,以后北京、河北等十几个省市均有报道。从近年报告的疫情资料来看,手足口病在中国呈蔓延上升趋势。手足口病临床上目前尚无特效药物,也没有疫苗等特异性治疗方法。研制具有抗病毒谱广、活性强的抗手足口病药物,保障我国婴幼儿的健康成长乃至社会经济的健康发展有着重要的社会意义。本文旨在以EV71的3C蛋白酶为靶点建立抗病毒药物筛选模型,主要建立了酵母逆向双杂交模型和体外模型,具有原始创新性。本研究建立了3C蛋白酶逆向酵母双杂交模型,利用PCR方法直接克隆获得3C蛋白酶基因、GAL4转录因子DNA结合结构域和转录激活结构域以及筛选标记基因URA3等基因片段,采用常规分子生物学手段进行表达载体构建,LiAc法转化酵母细胞,利用营养缺陷型筛选标记筛选得到酵母模型菌株,采用固体培养的方法进行药物的筛选,并且利用α-半乳糖苷酶活性在细胞水平建立药物活性的定量评价方法。本研究利用酵母细胞模型菌株固体培养的方法筛选了46种中成药,筛选得到了18种具有抑制活性的中药。选取活性较高的04口服液进行下一步实验,采用常规药物化学分离技术手段对04口服液进行分离提取,提取后的组分药再利用酵母模型固体培养方法筛选活性成分。首先利用石油醚、乙酸乙酯、正丁醇萃取分离,筛选结果表明乙酸乙酯和正丁醇部位有效。硅胶柱层析继续分离乙酸乙酯部分,活性跟踪结果表明活性组分分布在在第49至52组分;正丁醇部分利用反向C18柱进行分离,结果活性组分集中在5%,10%,15%甲醇洗脱部分,进一步从5%甲醇洗脱部分分离得到一单体分子,NMR、LC-MS等色谱技术结构鉴定确定其结构,此物质是否阳性药物有待进一步探讨。体外模型主要利用大肠杆菌表达系统表达EV71的3C蛋白酶。把3C蛋白酶基因亚克隆到表达载体pET21b,转化大肠杆菌细胞,低温诱导表达,镍柱亲和层析纯化获得高纯度的3C蛋白酶;合成制备自身具有荧光发射和荧光淬灭的多肽底物,建立体外的酶促反应体系和药物筛选体系,进行体外药物活性评价。本研究已经利用大肠杆菌进行了3C蛋白酶的表达纯化,对其蛋白酶活性进行了定性分析,上述工作为筛选活性药物分子奠定了基础。总之上述研究为研发抗手足口病的新药奠定了坚实的基础。另外,小RNA病毒的3C蛋白酶在序列和空间构象上具有一定的同源性,对3C蛋白酶活性的研究和探索有助于了解和研究3C蛋白酶,进而为治疗肠道病毒属等引起的疾病提供了科学依据和理论基础。
摘要第3-4页
ABSTRACT第4-5页
缩写词表第6-9页
第一部分 前言第9-16页
    1.1 研究背景第9-13页
        1.1.1 EV71与手足口病第9-10页
        1.1.2 EV71的3C蛋白酶及其他非结构蛋白第10-11页
        1.1.3 抗EV71的药物研究现状第11页
        1.1.4 酵母双杂交系统筛药模型第11-13页
    1.2 实验目的及意义第13-16页
第二部分 实验材料与常用分子生物学实验方法第16-24页
    2.1 实验材料第16-19页
        2.1.1 菌株第16页
        2.1.2 质粒第16页
        2.1.3 培养基及其溶液第16-17页
        2.1.4 溶剂及溶液第17-18页
        2.1.5 主要仪器与设备第18-19页
    2.2 常用分子生物学实验方法第19-24页
第三部分 逆向酵母双杂交系统筛药模型的建立第24-47页
    3.1 实验方法第24-31页
        3.1.1 酵母双杂交模型中3C融合基因的克隆第24-25页
        3.1.2 EV71其他功能基因的克隆第25-27页
        3.1.3 pGBKBD-AD质粒的构建第27-28页
        3.1.4 pGBKBD-AD-3C和pGBKBD-AD-3C~(mut)质粒的构建第28页
        3.1.5 酵母转化和阳性克隆的鉴定第28-29页
        3.1.6 运用酵母模型菌株进行抗EV713C蛋白酶的药物初筛第29页
        3.1.7 中药复筛第29-30页
        3.1.8 化学方法分离活性中药O4,固体培养法对O4组分进行活性部位跟踪第30-31页
    3.2 实验结果与分析第31-47页
        3.2.1 pGBKBD-AD-3C和pGBKBD-AD-3C~(mut)质粒的鉴定第31-36页
        3.2.2 EV71其他功能基因的克隆与序列分析第36-40页
        3.2.3 酵母转化和阳性克隆的鉴定第40-41页
        3.2.4 运用建立的酵母模型菌株进行药物筛选及活性跟踪结果第41-43页
        3.2.5 中药复筛结果第43-47页
第四部分 3C蛋白酶体外催化反应筛药模型的建立第47-62页
    4.1 实验方法第47-52页
        4.1.1 体外催化底物的合成第47-48页
        4.1.2 PCR合成EV71重组3C蛋白酶基因第48页
        4.1.3 重组3C蛋白酶在大肠杆菌中的表达第48-49页
        4.1.4 His-Tag柱层析体外纯化3C蛋白酶第49-50页
        4.1.5 Bio-rad Bradford对纯化的3C蛋白酶进行蛋白定量第50页
        4.1.6 建立体外酶促反应体系第50页
        4.1.7 重组3C蛋白酶的真核表达第50-52页
    4.2 实验结果与分析第52-62页
        4.2.1 重组3C蛋白酶的克隆与序列分析第52-55页
        4.2.2 重组3C蛋白酶在大肠杆菌B121中的表达与纯化第55-58页
        4.2.3 重组3C蛋白酶的体外催化反应第58-60页
        4.2.4 毕赤酵母甲醇诱导表达3C蛋白酶第60-62页
讨论与结论第62-65页
    讨论第62-64页
    结论第64-65页
参考文献第65-70页
攻读硕士学位期间已发表和待发表的论文第70-71页
致谢第71页
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